RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473244.5

MED15-222, Transcript of mediator complex subunit 15, human

TSL 1 (best)

Gene MED15, Length 2,733 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MED15-222	ENST00000473244	TEX10	Q9NXF1	929 aa	Predicted RBP	18.43	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	18.43	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	COL4A3	Q01955	1670 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	TRIM77	I1YAP6	450 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	SLC2A10	O95528	541 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	IGHA1	P01876	353 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	NR2F1	P10589	423 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	GSTM3	P21266	225 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	AHCY	P23526	432 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	BSG	P35613	385 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	OR10A3	P58181	314 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	ACSM1	Q08AH1	577 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	RPA4	Q13156	261 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	CPXM2	Q8N436	756 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	LHX9	Q9NQ69	397 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	ASB6	Q9NWX5	421 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	SRRD	Q9UH36	339 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	FAM170B	A6NMN3	283 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	EFCAB14	O75071	495 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	GNS	P15586	552 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	SLC36A2	Q495M3	483 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	OR51J1	Q9H342	316 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	GLTPD2	A6NH11	291 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	DHFR	P00374	187 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	AANAT	Q16613	207 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	HBM	Q6B0K9	141 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	HTR3D	Q70Z44	454 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	OAF	Q86UD1	273 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	FAM129C	Q86XR2	697 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	ART5	Q96L15	291 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	SURF4	O15260	269 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	TMPRSS11D	O60235	418 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	LEFTY1	O75610	366 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	TBXA2R	P21731	343 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	CRHR2	Q13324	411 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	SNTA1	Q13424	505 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	LINC00471	Q8N535	108 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	OR52N1	Q8NH53	320 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	RBP7	Q96R05	134 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	TIMP4	Q99727	224 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	SOCS6	O14544	535 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	SHC1	P29353	583 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	BMP8B	P34820	402 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	ZNF81	P51508	661 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	GAREM2	Q75VX8	874 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	AMER3	Q8N944	861 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	MTG2	Q9H4K7	406 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	PRR23A	A6NEV1	266 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	RNF13	O43567	381 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	TCRB	P04435	133 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	RFX3	P48380	749 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	PITPNB	P48739	271 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	TSPAN31	Q12999	210 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	CAMK2D	Q13557	499 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	KHDRBS2	Q5VWX1	349 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	CD276	Q5ZPR3	534 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	TPGS2	Q68CL5	300 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	BEST4	Q8NFU0	473 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	CEP76	Q8TAP6	659 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MED15-222	ENST00000473244	HGD	Q93099	445 aa		18.4	■□□□□ 0.54

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