RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468371.5

SHQ1-205, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SHQ1, Length 4,024 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-205ENST00000468371 LRRC46Q96FV0 321 aa5.64□□□□□ -1.51
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SHQ1-205ENST00000468371 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
SHQ1-205ENST00000468371 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
SHQ1-205ENST00000468371 TEX12Q9BXU0 123 aa5.64□□□□□ -1.51
SHQ1-205ENST00000468371 RBCK1Q9BYM8 510 aa5.64□□□□□ -1.51
SHQ1-205ENST00000468371 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
SHQ1-205ENST00000468371 PRSS21Q9Y6M0 314 aa5.64□□□□□ -1.51
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SHQ1-205ENST00000468371 ABOP16442 354 aa5.63□□□□□ -1.51
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SHQ1-205ENST00000468371 H0YGG7 62 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1-205ENST00000468371 TSPAN4O14817 238 aa5.63□□□□□ -1.51
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SHQ1-205ENST00000468371 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
SHQ1-205ENST00000468371 ST3GAL4Q11206 333 aa5.63□□□□□ -1.51
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SHQ1-205ENST00000468371 SSPNQ14714 243 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1-205ENST00000468371 CPTPQ5TA50 214 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1-205ENST00000468371 KANK2Q63ZY3 851 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1-205ENST00000468371 MED27Q6P2C8 311 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1-205ENST00000468371 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF547Q8IVP9 402 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1-205ENST00000468371 OR10G2Q8NGC3 310 aa5.63□□□□□ -1.51
SHQ1-205ENST00000468371 SLC38A4Q969I6 547 aa5.63□□□□□ -1.51
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