RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466245.1

TTLL3-223, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 3

Gene TTLL3, Length 616 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-223	ENST00000466245	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	ACOT7	O00154	380 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	PDPK1	O15530	556 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	PPM1B	O75688	479 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	SOX30	O94993	753 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	SNX4	O95219	450 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	IGHG3	P01860	377 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	CT45A8	P0DMV1	189 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	CT45A9	P0DMV2	189 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	MAP3K8	P41279	467 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	CLDN8	P56748	225 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	OCRL	Q01968	901 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	PMPCA	Q10713	525 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	LTB4R	Q15722	352 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	GALNTL6	Q49A17	601 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	RNF138	Q8WVD3	245 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	PPCDC	Q96CD2	204 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	COQ8B	Q96D53	544 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	ELP4	Q96EB1	424 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC35A4	Q96G79	324 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	DLL4	Q9NR61	685 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	DEPP	Q9NTK1	212 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	EIF3L	Q9Y262	564 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	RTTN	Q86VV8	2226 aa		9.21	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	NCKAP5	O14513	1909 aa		9.21	□□□□□ -0.93
TTLL3-223	ENST00000466245	ATP6AP2	A0A1C7CYW4	349 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-223	ENST00000466245	WDR91	A4D1P6	747 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-223	ENST00000466245	OR14I1	A6ND48	311 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-223	ENST00000466245	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-223	ENST00000466245	HDAC3	O15379	428 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-223	ENST00000466245	PEX11A	O75192	247 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-223	ENST00000466245	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-223	ENST00000466245	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-223	ENST00000466245	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-223	ENST00000466245	CTAG2	O75638	210 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-223	ENST00000466245	ATP6AP2	O75787	350 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-223	ENST00000466245	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-223	ENST00000466245	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-223	ENST00000466245	FREM3	P0C091	2139 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-223	ENST00000466245	CCL3	P10147	92 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-223	ENST00000466245	KIR2DL3	P43628	341 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-223	ENST00000466245	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-223	ENST00000466245	PNLIPRP2	P54317	469 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-223	ENST00000466245	KEAP1	Q14145	624 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-223	ENST00000466245	PTGR1	Q14914	329 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-223	ENST00000466245	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-223	ENST00000466245	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC25A35	Q3KQZ1	300 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-223	ENST00000466245	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-223	ENST00000466245	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-223	ENST00000466245	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-223	ENST00000466245	IL23R	Q5VWK5	629 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-223	ENST00000466245	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-223	ENST00000466245	ARSK	Q6UWY0	536 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-223	ENST00000466245	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-223	ENST00000466245	TMEM64	Q6YI46	380 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-223	ENST00000466245	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-223	ENST00000466245	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-223	ENST00000466245	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-223	ENST00000466245	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-223	ENST00000466245	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-223	ENST00000466245	FNDC5	Q8NAU1	212 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-223	ENST00000466245	OR7G2	Q8NG99	324 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-223	ENST00000466245	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-223	ENST00000466245	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-223	ENST00000466245	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-223	ENST00000466245	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-223	ENST00000466245	AGR3	Q8TD06	166 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-223	ENST00000466245	NUDT8	Q8WV74	236 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-223	ENST00000466245	STON2	Q8WXE9	905 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-223	ENST00000466245	ARL8A	Q96BM9	186 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-223	ENST00000466245	TESC	Q96BS2	214 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-223	ENST00000466245	MBD6	Q96DN6	1003 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-223	ENST00000466245	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		9.21	□□□□□ -0.94

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms