RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 REM1O75628 298 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 C6orf47O95873 294 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 CHEK2O96017 543 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 MYZAPP0CAP1 466 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 KITP10721 976 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 ACP2P11117 423 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 GP1BBP13224 206 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 PTPN6P29350 595 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 PTGS2P35354 604 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 RPL14P50914 215 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
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RABGEF1-206ENST00000461017 EMX2Q04743 252 aa6.4□□□□□ -1.38
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RABGEF1-206ENST00000461017 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 EIPR1Q53HC9 387 aa6.4□□□□□ -1.38
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RABGEF1-206ENST00000461017 C6orf163Q5TEZ5 329 aa6.4□□□□□ -1.38
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RABGEF1-206ENST00000461017 PLXDC2Q6UX71 529 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 GK5Q6ZS86 529 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 IKBIPQ70UQ0 350 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 NUP54Q7Z3B4 507 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
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RABGEF1-206ENST00000461017 FNDC5Q8NAU1 212 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 NUP43Q8NFH3 380 aa6.4□□□□□ -1.38
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RABGEF1-206ENST00000461017 FAM57AQ8TBR7 257 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 PPCDCQ96CD2 204 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 COQ8BQ96D53 544 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC35A4Q96G79 324 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 PPP3R2Q96LZ3 170 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 NPAS1Q99742 590 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 SH3GL2Q99962 352 aa6.4□□□□□ -1.38
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RABGEF1-206ENST00000461017 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 CXorf36Q9H7Y0 433 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 MEAF6Q9HAF1 191 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 MIEF1Q9NQG6 463 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 CNIH4Q9P003 139 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 FBXL2Q9UKC9 423 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 CFL2Q9Y281 166 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
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RABGEF1-206ENST00000461017 GOLGA8NF8WBI6 632 aa6.39□□□□□ -1.39
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RABGEF1-206ENST00000461017 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
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RABGEF1-206ENST00000461017 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 NKX2-2O95096 273 aa6.39□□□□□ -1.39
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RABGEF1-206ENST00000461017 PRPS2P11908 318 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 CD1EP15812 388 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 ABOP16442 354 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 NAGAP17050 411 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 GRK2P25098 689 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 NTSP30990 170 aa6.39□□□□□ -1.39
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RABGEF1-206ENST00000461017 ASMTP46597 345 aa6.39□□□□□ -1.39
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RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
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RABGEF1-206ENST00000461017 DUSP5Q16690 384 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM198Q66K66 360 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 OR4F3Q6IEY1 312 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 SEM1Q6ZVN7 128 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 OLIG3Q7RTU3 272 aa6.39□□□□□ -1.39
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