RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459697.1

RABGGTB-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,177 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-203ENST00000459697 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 CHRNB3Q05901 458 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 PTK6Q13882 451 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 NAA25Q14CX7 972 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 CCNG2Q16589 344 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 CDO1Q16878 200 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 HKDC1Q2TB90 917 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 XKR6Q5GH73 641 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 PCID2Q5JVF3 399 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 GPR157Q5UAW9 335 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 PRAMEF20Q5VT98 475 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 ADNP2Q6IQ32 1131 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 LRRC8BQ6P9F7 803 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 TMCO3Q6UWJ1 677 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 RAD9BQ6WBX8 426 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 PRSS41Q7RTY9 318 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 SNX32Q86XE0 403 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 PDSS2Q86YH6 399 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 CNTN4Q8IWV2 1026 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 PYROXD2Q8N2H3 581 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 LPCAT1Q8NF37 534 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 OR51Q1Q8NH59 317 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 BRSK1Q8TDC3 778 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 ATP6V1E2Q96A05 226 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF653Q96CK0 615 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 CCDC34Q96HJ3 373 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 TMEM41AQ96HV5 264 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 CLPTM1LQ96KA5 538 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 MRGPRX4Q96LA9 322 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 RCHY1Q96PM5 261 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 GPA33Q99795 319 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 DHRS9Q9BPW9 319 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 BPIFA1Q9NP55 256 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 HOMER3Q9NSC5 361 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 ETAA1Q9NY74 926 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 WWOXQ9NZC7 414 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 OR6C2Q9NZP2 312 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 ADAM22Q9P0K1 906 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 POU2F3Q9UKI9 436 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 PROCRQ9UNN8 238 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 HPSEQ9Y251 543 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 LRP12Q9Y561 859 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 KLK4Q9Y5K2 254 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 A0A0G2JMP0 313 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 A0A0X1KG70 313 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 SAGE2PA6NJ88 616 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF785A8K8V0 405 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 E7EQL1 145 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 WWP2O00308 870 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 ABCD4O14678 606 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 MED7O43513 233 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 ERLIN1O75477 346 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 TJP3O95049 919 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 NDUFA7O95182 113 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 STAMBPO95630 424 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 CGAP01215 116 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 CYP1A2P05177 515 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 CRHP06850 196 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 AKT1P31749 480 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 CLCN2P51788 898 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF134P52741 427 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 ARL4CP56559 192 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 RHAGQ02094 409 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 IL10RBQ08334 325 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 PMS2P11Q13670 270 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 PRTGQ2VWP7 1150 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 SCIMPQ6UWF3 145 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 SUSD1Q6UWL2 747 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 GALNT5Q7Z7M9 940 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 CCDC185Q8N715 623 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 NANOGP1Q8N7R0 232 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 OR4M2Q8NGB6 313 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 OR5AR1Q8NGP9 310 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 OR9A4Q8NGU2 314 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 S100PBPQ96BU1 408 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 VPS35Q96QK1 796 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 RASL10BQ96S79 203 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC52A3Q9NQ40 469 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 TMEM51Q9NW97 253 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 TAS2R16Q9NYV7 291 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 GRHPRQ9UBQ7 328 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 UTS2RQ9UKP6 389 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 SHOC2Q9UQ13 582 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 SNX8Q9Y5X2 465 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-203ENST00000459697 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-203ENST00000459697 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa4.02□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms