RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 SLC29A2Q14542 456 aa19.05■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa19.05■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM42Q8IWZ5 723 aa19.05■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 OR7G2Q8NG99 324 aa19.05■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 FAM76AQ8TAV0 307 aa19.05■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP19.05■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 G6PC3Q9BUM1 346 aa19.05■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 TMUB1Q9BVT8 246 aa19.05■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 TAS2R7Q9NYW3 318 aa19.05■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 SENP1Q9P0U3 644 aa19.05■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 FBXL2Q9UKC9 423 aa19.05■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 EMCNQ9ULC0 261 aa19.05■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 ITPR3Q14573 2671 aa19.05■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 GOLGA8RI6L899 631 aa19.04■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 GLRA3O75311 464 aa19.04■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 IFI6P09912 130 aa19.04■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF708P17019 499 aa19.04■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 PSG6Q00889 435 aa19.04■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 BCL2A1Q16548 175 aa19.04■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP19.04■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM46Q7Z4K8 759 aa19.04■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 MBD6Q96DN6 1003 aa19.04■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 ALPK1Q96QP1 1244 aa19.04■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 EBPLQ9BY08 206 aa19.04■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 MID1IP1Q9NPA3 183 aa19.04■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 MYNNQ9NPC7 610 aa19.04■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 CLCA1A8K7I4 914 aa19.03■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 G3V2L1 256 aa19.03■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 PLOD2O00469 737 aa19.03■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 HCRTR2O43614 444 aa19.03■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 PSMG1O95456 288 aa19.03■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 DNASE1P24855 282 aa19.03■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 GRK2P25098 689 aa19.03■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 FOXA1P55317 472 aa19.03■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 CLDN18P56856 261 aa19.03■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 FOXF2Q12947 444 aa19.03■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 GAB1Q13480 694 aa19.03■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 FAM71E1Q6IPT2 247 aa19.03■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 PAMR1Q6UXH9 720 aa19.03■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 ZYG11AQ6WRX3 759 aa19.03■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 KIF18AQ8NI77 898 aa19.03■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 RDH11Q8TC12 318 aa19.03■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 SFXN2Q96NB2 322 aa19.03■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 BBS4Q96RK4 519 aa19.03■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 PIGMQ9H3S5 423 aa19.03■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 LIME1Q9H400 295 aa19.03■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 ABCG2Q9UNQ0 655 aa19.03■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 B4DXG7 233 aa19.02■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 FAM153BP0C7A2 387 aa19.02■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 MYL2P10916 166 aa19.02■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 EVI2BP34910 448 aa19.02■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 BTKQ06187 659 aa19.02■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 C2orf80Q0P641 193 aa19.02■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 FAM153CQ494X1 144 aa19.02■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 CYP27C1Q4G0S4 372 aa19.02■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 SPDYAQ5MJ70 313 aa19.02■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 FRMD7Q6ZUT3 714 aa19.02■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 SH2D5Q6ZV89 423 aa19.02■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 IKBIPQ70UQ0 350 aa19.02■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 CAMKMTQ7Z624 323 aa19.02■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa19.02■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 FADS6Q8N9I5 356 aa19.02■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 MIEF1Q9NQG6 463 aa19.02■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 DKKL1Q9UK85 242 aa19.02■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 OR10H1Q9Y4A9 318 aa19.02■□□□□ 0.64
LIMS1-208ENST00000428064 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 NPIPB8E9PQR5 432 aa19.01■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 ZIC3O60481 467 aa19.01■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 NME6O75414 186 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 CD99P14209 185 aa19.01■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 DPP4P27487 766 aa19.01■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 PCYT1AP49585 367 aa19.01■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP19.01■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 B3GALT5-AS1P59052 145 aa19.01■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 DNAJB13P59910 316 aa19.01■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 SRYQ05066 204 aa19.01■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 GANABQ14697 944 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 IMPG1Q17R60 797 aa19.01■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC153Q494R4 210 aa19.01■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 OR2L13Q8N349 312 aa19.01■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 CCNYL1Q8N7R7 359 aa19.01■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 OR4N2Q8NGD1 307 aa19.01■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 DACH2Q96NX9 599 aa19.01■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 TBK1Q9UHD2 729 aa19.01■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 PROCP04070 461 aa19■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 JUNP05412 331 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
LIMS1-208ENST00000428064 CRHP06850 196 aa19■□□□□ 0.63
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