RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415172.1

VPS13A-AS1-201, VPS13A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A-AS1, Length 519 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ANGPTL4Q9BY76 406 aa15.93■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CXorf36Q9H7Y0 433 aa15.93■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PROK2Q9HC23 129 aa15.93■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KLRF1Q9NZS2 232 aa15.93■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OSGIN2Q9Y236 505 aa15.93■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GPR45Q9Y5Y3 372 aa15.93■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SHANK1Q9Y566 2161 aa15.93■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TEX15Q9BXT5 2789 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRAMEF25A6NGN4 478 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UBDO15205 165 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TSPAN2O60636 221 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KCNH1O95259 989 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 S100A3P33764 101 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GABRA3P34903 492 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UFM1P61960 85 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HBA1P69905 142 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SNTA1Q13424 505 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GAB1Q13480 694 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TP53BP2Q13625 1128 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CMPK2Q5EBM0 449 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC30A6Q6NXT4 461 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PAOXQ6QHF9 649 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CLECL1Q8IZS7 167 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM251Q8N6I4 163 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR52N2Q8NGI0 321 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FBXO30Q8TB52 745 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SFXN5Q8TD22 340 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 JADE3Q92613 823 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GIMAP5Q96F15 307 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MARK4Q96L34 752 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NODALQ96S42 347 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OSBPL11Q9BXB4 747 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TCF7L2Q9NQB0 619 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa15.91■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LRRC3CA6NJW4 275 aa15.91■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 WISP2O76076 250 aa15.91■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AGFG2O95081 481 aa15.91■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NKX2-2O95096 273 aa15.91■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KRT16P08779 473 aa15.91■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ALOX5P09917 674 aa15.91■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MAGEA5P43359 124 aa15.91■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IDH3AP50213 366 aa15.91■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AQP5P55064 265 aa15.91■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CASP6P55212 293 aa15.91■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 WNT3P56703 355 aa15.91■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DESI1Q6ICB0 168 aa15.91■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR4A15Q8NGL6 344 aa15.91■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CHMP6Q96FZ7 201 aa15.91■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM41AQ96HV5 264 aa15.91■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TEX37Q96LM6 180 aa15.91■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DEFB127Q9H1M4 99 aa15.91■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC19A2O60779 497 aa15.9■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC22A3O75751 556 aa15.9■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IL33O95760 270 aa15.9■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PGRP06401 933 aa15.9■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 STSP08842 583 aa15.9■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ACP2P11117 423 aa15.9■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ABOP16442 354 aa15.9■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MAP3K8P41279 467 aa15.9■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RFX3P48380 749 aa15.9■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 STX1BP61266 288 aa15.9■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HSF1Q00613 529 aa15.9■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa15.9■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ANKRD46Q86W74 232 aa15.9■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 COX18Q8N8Q8 333 aa15.9■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC16A11Q8NCK7 471 aa15.9■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR5AK3PQ8NH89 298 aa15.9■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PIK3R3Q92569 461 aa15.9■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EBF4Q9BQW3 602 aa15.9■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 YIPF4Q9BSR8 244 aa15.9■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCDC28BQ9BUN5 200 aa15.9■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 QPCTLQ9NXS2 382 aa15.9■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZIM2Q9NZV7 527 aa15.9■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC5A6Q9Y289 635 aa15.9■□□□□ 0.14
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa15.89■□□□□ 0.13
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa15.89■□□□□ 0.13
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GXYLT2A0PJZ3 443 aa15.89■□□□□ 0.13
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C9JVG2 144 aa15.89■□□□□ 0.13
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EDF1O60869 148 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SCN2BO60939 215 aa15.89■□□□□ 0.13
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ICOSLGO75144 302 aa15.89■□□□□ 0.13
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PDE9AO76083 593 aa15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.9 ms