RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409945.1

USP40-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP40, Length 1,946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-202ENST00000409945 C9J4A7 227 aa5.94□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 E7EQ34 232 aa5.94□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 RASGRF2O14827 1237 aa5.94□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 TTI1O43156 1089 aa5.94□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 SPAG6O75602 509 aa5.94□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 CCNDBP1O95273 360 aa5.94□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 TCN2P20062 427 aa5.94□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 HIST1H2ADP20671 130 aa5.94□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 CD9P21926 228 aa5.94□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 MAGEA3P43357 314 aa5.94□□□□□ -1.46
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USP40-202ENST00000409945 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 CRYMQ14894 314 aa5.94□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 KYNUQ16719 465 aa5.94□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 C2orf68Q2NKX9 166 aa5.94□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa5.94□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 SGO1Q5FBB7 561 aa5.94□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 CNSTQ6PJW8 725 aa5.94□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 IGFN1Q86VF2 1251 aa5.94□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 IQCKQ8N0W5 287 aa5.94□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa5.94□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 PYROXD1Q8WU10 500 aa5.94□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 CERS2Q96G23 380 aa5.94□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 CFAP36Q96G28 342 aa5.94□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 VPS39Q96JC1 886 aa5.94□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 H2AFJQ9BTM1 129 aa5.94□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 KLHL31Q9H511 634 aa5.94□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 TXLNGQ9NUQ3 528 aa5.94□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 PADI2Q9Y2J8 665 aa5.94□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa5.94□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 CHD6Q8TD26 2715 aa5.94□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 GOLGA6L10A6NI86 522 aa5.93□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 TMEM150CB9EJG8 249 aa5.93□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP5.93□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 SEC14L5O43304 696 aa5.93□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 NIPSNAP2O75323 286 aa5.93□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 NKX2-2O95096 273 aa5.93□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 NDUFB8O95169 186 aa5.93□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 LCKP06239 509 aa5.93□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 MPC1LP0DKB6 136 aa5.93□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 UGT2B7P16662 529 aa5.93□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 CMPK1P30085 196 aa5.93□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 PKLRP30613 574 aa5.93□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 DLSTP36957 453 aa5.93□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 SLC1A2P43004 574 aa5.93□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 ARHGAP19Q14CB8 494 aa5.93□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 TGIF1Q15583 401 aa5.93□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
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USP40-202ENST00000409945 VASH2Q86V25 355 aa5.93□□□□□ -1.46
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USP40-202ENST00000409945 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 OR2L8Q8NGY9 312 aa5.93□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 MCOLN3Q8TDD5 553 aa5.93□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 MR1Q95460 341 aa5.93□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 COQ8BQ96D53 544 aa5.93□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 SLC45A3Q96JT2 553 aa5.93□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 ERP44Q9BS26 406 aa5.93□□□□□ -1.46
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USP40-202ENST00000409945 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa5.93□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 TSPYL1Q9H0U9 437 aa5.93□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 XKR8Q9H6D3 395 aa5.93□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 APMAPQ9HDC9 416 aa5.93□□□□□ -1.46
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USP40-202ENST00000409945 CHMP2BQ9UQN3 213 aa5.93□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 ITPR1Q14643 2758 aa5.93□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa5.93□□□□□ -1.46
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USP40-202ENST00000409945 LIFP15018 202 aa5.93□□□□□ -1.46
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USP40-202ENST00000409945 ELK3P41970 407 aa5.93□□□□□ -1.46
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USP40-202ENST00000409945 PPP1CAP62136 330 aa5.93□□□□□ -1.46
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USP40-202ENST00000409945 GSTA3Q16772 222 aa5.93□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 KLHL38Q2WGJ6 581 aa5.93□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 CTSL3PQ5NE16 218 aa5.93□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 DUPD1Q68J44 220 aa5.93□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 FAM45BPQ6NSW5 357 aa5.93□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 KLHL24Q6TFL4 600 aa5.93□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 DEF8Q6ZN54 512 aa5.93□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 DENND6AQ8IWF6 608 aa5.93□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 ZBED8Q8IZ13 594 aa5.93□□□□□ -1.46
USP40-202ENST00000409945 TBC1D19Q8N5T2 526 aa5.93□□□□□ -1.46
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