RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
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HOXD12-201ENST00000404162 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP17.24■□□□□ 0.35
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HOXD12-201ENST00000404162 TMEM160Q9NX00 188 aa17.24■□□□□ 0.35
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HOXD12-201ENST00000404162 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP17.22■□□□□ 0.35
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HOXD12-201ENST00000404162 CTAGE4Q8IX94 777 aa17.22■□□□□ 0.35
HOXD12-201ENST00000404162 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa17.22■□□□□ 0.35
HOXD12-201ENST00000404162 L3MBTL4Q8NA19 623 aa17.22■□□□□ 0.35
HOXD12-201ENST00000404162 KBTBD8Q8NFY9 601 aa17.22■□□□□ 0.35
HOXD12-201ENST00000404162 OR4N2Q8NGD1 307 aa17.22■□□□□ 0.35
HOXD12-201ENST00000404162 S100PBPQ96BU1 408 aa17.22■□□□□ 0.35
HOXD12-201ENST00000404162 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF681Q96N22 645 aa17.22■□□□□ 0.35
HOXD12-201ENST00000404162 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
HOXD12-201ENST00000404162 RTN4RQ9BZR6 473 aa17.22■□□□□ 0.35
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