RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403027.6

CNOT8-202, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNOT8, Length 2,604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8-202ENST00000403027 NECTIN4Q96NY8 510 aa14.7□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 TRPV5Q9NQA5 729 aa14.7□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 FBXO8Q9NRD0 319 aa14.7□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 NTNG1Q9Y2I2 539 aa14.7□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 NOX1Q9Y5S8 564 aa14.7□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 LRRTM2O43300 516 aa14.69□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 AVPR1BP47901 424 aa14.69□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.068e-11■□□□□ 8.7
CNOT8-202ENST00000403027 C16orf62Q7Z3J2 963 aa14.69□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 TCEANCQ8N8B7 351 aa14.69□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 MORN4Q8NDC4 146 aa14.69□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 TMEM52Q8NDY8 209 aa14.69□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 OR4K14Q8NGD5 310 aa14.69□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 ADAMTS15Q8TE58 950 aa14.69□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 CDS1Q92903 461 aa14.69□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 MOAP1Q96BY2 351 aa14.69□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 CTRCQ99895 268 aa14.69□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 CLN6Q9NWW5 311 aa14.69□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 TVP23BQ9NYZ1 205 aa14.69□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 MTCH2Q9Y6C9 303 aa14.69□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 CTSBP07858 339 aa14.69□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 SPNP16150 400 aa14.69□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 TYRP1P17643 537 aa14.69□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 SERPINB10P48595 397 aa14.69□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 TGM4P49221 684 aa14.69□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 TPTEP56180 551 aa14.69□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa14.69□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 MINDY2Q8NBR6 621 aa14.69□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 GPBAR1Q8TDU6 330 aa14.69□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa14.69□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 ACTRT3Q9BYD9 372 aa14.69□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 RERGLQ9H628 205 aa14.69□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 CLEC2DQ9UHP7 191 aa14.69□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 ZNF229Q9UJW7 825 aa14.69□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 A0A087WUU8 490 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 APOL3O95236 402 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 TNFP01375 233 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 SMIM11AP58511 58 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 GNA13Q14344 377 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 CCNJQ5T5M9 372 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 TAF8Q7Z7C8 310 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 FCGR1BQ92637 280 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 SERINC2Q96SA4 455 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 KCNS3Q9BQ31 491 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 CDADC1Q9BWV3 514 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 GPR174Q9BXC1 333 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 NDEL1Q9GZM8 345 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 TWSG1Q9GZX9 223 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 WWP2O00308 870 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 B3GALT2O43825 422 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 ALOX12P18054 663 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 SOX3P41225 446 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 SELENBP1Q13228 472 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 IRF3Q14653 427 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 TSTQ16762 297 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 ZNF404Q494X3 552 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 SLX4IPQ5VYV7 408 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 ACSM5Q6NUN0 579 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 MFSD12Q6NUT3 480 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 CASP12Q6UXS9 341 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 PRRC1Q96M27 445 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 BCL7BQ9BQE9 202 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 PINK1Q9BXM7 581 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 KLHL3Q9UH77 587 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 SLC22A7Q9Y694 548 aa14.68□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 SH3D21A4FU49 640 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 PRKYO43930 277 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 SSX4O60224 188 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 MPZL2O60487 215 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 ALPPP05187 535 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 IGFBP4P22692 258 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 SLC15A1P46059 708 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 RGS6P49758 472 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 TEKQ02763 1124 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 STEAP3Q658P3 488 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 PAQR6Q6TCH4 344 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 S100ZQ8WXG8 99 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 SLC6A18Q96N87 628 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 EGLN3Q9H6Z9 239 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 SLC25A19Q9HC21 320 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 SEMA4GQ9NTN9 838 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 IFT52Q9Y366 437 aa14.67□□□□□ -0.06
CNOT8-202ENST00000403027 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.6 ms