RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 OR51L1Q8NGJ5 315 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 MYLIPQ8WY64 445 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 EMC7Q9NPA0 242 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 FBXO8Q9NRD0 319 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 HSFX1Q9UBD0 423 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 EPHA6Q9UF33 1036 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 MYH11P35749 1972 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 OR2A25A4D2G3 310 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 OR7A17O14581 309 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 CPNE6O95741 557 aa9.31□□□□□ -0.92
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HERC3-202ENST00000402738 RPL17P18621 184 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 TM4SF1P30408 202 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 TGFBR1P36897 503 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 VEZF1Q14119 521 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP9.31□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 ADGRF1Q5T601 910 aa9.31□□□□□ -0.92
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HERC3-202ENST00000402738 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
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HERC3-202ENST00000402738 SLIT2O94813 1529 aa9.3□□□□□ -0.92
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HERC3-202ENST00000402738 GKP32189 559 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 PCGF2P35227 344 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 RPS25P62851 125 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 CD300CQ08708 224 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 RAB40BQ12829 278 aa9.3□□□□□ -0.92
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HERC3-202ENST00000402738 CARD16Q5EG05 197 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 SERPINA11Q86U17 422 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 TMEM130Q8N3G9 435 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 PXT1Q8NFP0 134 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 SUN3Q8TAQ9 357 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 SAMD8Q96LT4 415 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 IL21RQ9HBE5 538 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 ADRB3P13945 408 aa9.3□□□□□ -0.92
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HERC3-202ENST00000402738 CD9P21926 228 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 WASP42768 502 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 ID2Q02363 134 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 MAPK14Q16539 360 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 IER5LQ5T953 404 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 FCRLBQ6BAA4 426 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 OR52E2Q8NGJ4 325 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 SYNPRQ8TBG9 265 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 METTL21AQ8WXB1 218 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 SAMD11Q96NU1 681 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 MICU1Q9BPX6 476 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 DNTTIP1Q9H147 329 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
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HERC3-202ENST00000402738 CYCSP99999 105 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 CDC20Q12834 499 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 HTR4Q13639 388 aa9.3□□□□□ -0.92
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HERC3-202ENST00000402738 HACD4Q5VWC8 232 aa9.3□□□□□ -0.92
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HERC3-202ENST00000402738 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 OR4K13Q8NH42 304 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 SMPDL3AQ92484 453 aa9.3□□□□□ -0.92
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HERC3-202ENST00000402738 RETREG1Q9H6L5 497 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 TCRBP04435 133 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 CSF1P09603 554 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 RD3LP0DJH9 198 aa9.3□□□□□ -0.92
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HERC3-202ENST00000402738 NUDT1P36639 197 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 PPT1P50897 306 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 ERVK-21P61565 698 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 PGAP1Q75T13 922 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 PRSS58Q8IYP2 241 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 CYB561A3Q8NBI2 242 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 OR4E2Q8NGC2 313 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 TERB2Q8NHR7 220 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 HUS1BQ8NHY5 278 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 PSD2Q9BQI7 771 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 RXFP3Q9NSD7 469 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 MEIS3P2A8K0S8 358 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 POP7O75817 140 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 LATS1O95835 1130 aa9.29□□□□□ -0.92
HERC3-202ENST00000402738 TXNDC12O95881 172 aa9.29□□□□□ -0.92
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