RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376545.7

ABCF1-202, Transcript of ATP binding cassette subfamily F member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ABCF1, Length 3,131 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF1-202ENST00000376545 FAM78AQ5JUQ0 283 aa10□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 VASNQ6EMK4 673 aa10□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 CCDC116Q8IYX3 515 aa10□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 OR8K5Q8NH50 307 aa10□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 SUSD6Q92537 303 aa10□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 RNF31Q96EP0 1072 aa10□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 DIRAS2Q96HU8 199 aa10□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 ASB16Q96NS5 453 aa10□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 SLC38A2Q96QD8 506 aa10□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 YIPF4Q9BSR8 244 aa10□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 CALML5Q9NZT1 146 aa10□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 CHD7Q9P2D1 2997 aa10□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 DOCK9Q9BZ29 2069 aa10□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 A0A1W2PS29 197 aa10□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 ANTXRLA6NF34 631 aa10□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 GLOD5A6NK44 160 aa10□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 C5orf67F2Z3F1 127 aa10□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 LRRTM2O43300 516 aa10□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 IDH3BO43837 385 aa10□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 HLA-DMAP28067 261 aa10□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 KIR2DL3P43628 341 aa10□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 TAS2R41P59536 307 aa10□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 PRR5P85299 388 aa10□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 CHRNEQ04844 493 aa10□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 ENPP2Q13822 863 aa10□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 CDK10Q15131 360 aa10□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 GPAT3Q53EU6 434 aa10□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa10□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 TMEM107Q6UX40 140 aa10□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 HMGN2P46Q86SG4 172 aa10□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 VRK2Q86Y07 508 aa10□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 SYT14Q8NB59 555 aa10□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 SLC7A6Q92536 515 aa10□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa10□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 DEPDC7Q96QD5 511 aa10□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 TM9SF2Q99805 663 aa10□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 PRR14Q9BWN1 585 aa10□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 PRRG3Q9BZD7 231 aa10□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 BTBD1Q9H0C5 482 aa10□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 ANKRA2Q9H9E1 313 aa10□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa10□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 GPR52Q9Y2T5 361 aa10□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 ERI3O43414 337 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 SCO2O43819 266 aa9.99□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 HCN1O60741 890 aa9.99□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 KCNJ13O60928 360 aa9.99□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 ACP5P13686 325 aa9.99□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 PRKAG1P54619 331 aa9.99□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 FGL2Q14314 439 aa9.99□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 C18orf63Q68DL7 685 aa9.99□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 ZNF425Q6IV72 752 aa9.99□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 LIX1LQ8IVB5 337 aa9.99□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 MFSD9Q8NBP5 474 aa9.99□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 DUSP18Q8NEJ0 188 aa9.99□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa9.99□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 OR2L3Q8NG85 312 aa9.99□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 OR52N1Q8NH53 320 aa9.99□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 OSTF1Q92882 214 aa9.99□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 RFKQ969G6 155 aa9.99□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 ATF6BQ99941 703 aa9.99□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 MMP28Q9H239 520 aa9.99□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 ASB6Q9NWX5 421 aa9.99□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa9.99□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 MPIP34949 423 aa9.99□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 IRF4Q15306 451 aa9.99□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa9.99□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 C2orf27AQ580R0 203 aa9.99□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 SZRD1Q7Z422 152 aa9.99□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 PSD4Q8NDX1 1056 aa9.99□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 SIMC1Q8NDZ2 872 aa9.99□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 NUP43Q8NFH3 380 aa9.99□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 OR52E1Q8NGJ3 308 aa9.99□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 CHFRQ96EP1 664 aa9.99□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 C10orf90Q96M02 699 aa9.99□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 KCNJ15Q99712 375 aa9.99□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 XKR8Q9H6D3 395 aa9.99□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 WDR26Q9H7D7 661 aa9.99□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 CNIH4Q9P003 139 aa9.99□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 POLHQ9Y253 713 aa9.99□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa9.99□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 OR1A2Q9Y585 309 aa9.99□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 COL4A2P08572 1712 aa9.98□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
ABCF1-202ENST00000376545 SERPIND1P05546 499 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms