RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334414.10

PTPRB-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 12,316 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-202ENST00000334414 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-202ENST00000334414 PINK1Q9BXM7 581 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-202ENST00000334414 SACM1LQ9NTJ5 587 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-202ENST00000334414 BTNL2Q9UIR0 455 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-202ENST00000334414 TP53I11O14683 189 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-202ENST00000334414 OR2F2O95006 317 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-202ENST00000334414 BDKRB1P46663 353 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-202ENST00000334414 DAP3P51398 398 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-202ENST00000334414 AKR1C2P52895 323 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-202ENST00000334414 TEKQ02763 1124 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-202ENST00000334414 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-202ENST00000334414 OR2F1Q13607 317 aa5.26□□□□□ -1.57
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PTPRB-202ENST00000334414 PPA1Q15181 289 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-202ENST00000334414 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-202ENST00000334414 TEX26Q8N6G2 289 aa5.26□□□□□ -1.57
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PTPRB-202ENST00000334414 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-202ENST00000334414 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
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PTPRB-202ENST00000334414 EDNRBP24530 442 aa5.26□□□□□ -1.57
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PTPRB-202ENST00000334414 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-202ENST00000334414 CTPS2Q9NRF8 586 aa5.26□□□□□ -1.57
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PTPRB-202ENST00000334414 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-202ENST00000334414 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-202ENST00000334414 MAST2Q6P0Q8 1798 aa5.25□□□□□ -1.57
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PTPRB-202ENST00000334414 M0QZK8 103 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-202ENST00000334414 RFXAPO00287 272 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-202ENST00000334414 GPR39O43194 453 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-202ENST00000334414 GGCTO75223 188 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
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PTPRB-202ENST00000334414 HLA-DOBP13765 273 aa5.25□□□□□ -1.57
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PTPRB-202ENST00000334414 SELENOVP59797 346 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-202ENST00000334414 GLO1Q04760 184 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-202ENST00000334414 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
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PTPRB-202ENST00000334414 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-202ENST00000334414 OR5D14Q8NGL3 314 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-202ENST00000334414 ZFP90Q8TF47 636 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-202ENST00000334414 FRS2Q8WU20 508 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-202ENST00000334414 CHRDQ9H2X0 955 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-202ENST00000334414 FBXO8Q9NRD0 319 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-202ENST00000334414 DZANK1Q9NVP4 752 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-202ENST00000334414 KLHL42Q9P2K6 505 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-202ENST00000334414 OR6C74A6NCV1 312 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-202ENST00000334414 FGF4P08620 206 aa5.25□□□□□ -1.57
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PTPRB-202ENST00000334414 LSSP48449 732 aa5.25□□□□□ -1.57
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PTPRB-202ENST00000334414 IL26Q9NPH9 171 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-202ENST00000334414 THSD1Q9NS62 852 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-202ENST00000334414 TSPAN11A1L157 253 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-202ENST00000334414 SDHDO14521 159 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-202ENST00000334414 APBB3O95704 486 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-202ENST00000334414 PDGFAP04085 211 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-202ENST00000334414 HLA-DQB2P05538 268 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-202ENST00000334414 PIPP12273 146 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-202ENST00000334414 NDUFV1P49821 464 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-202ENST00000334414 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-202ENST00000334414 GPR68Q15743 365 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-202ENST00000334414 FAM214AQ32MH5 1076 aa5.25□□□□□ -1.57
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