RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325103.10

HPS1-201, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HPS1, Length 3,703 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-201ENST00000325103 GXYLT2A0PJZ3 443 aa12.14□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 PEX12O00623 359 aa12.14□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 MYL12BO14950 172 aa12.14□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 DUX1O43812 170 aa12.14□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 MAGEA2P43356 314 aa12.14□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 RNF44Q7L0R7 432 aa12.14□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 SPEM1Q8N4L4 309 aa12.14□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 OR52E4Q8NGH9 312 aa12.14□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 OR51A7Q8NH64 312 aa12.14□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 TP53INP1Q96A56 240 aa12.14□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 MSANTD3Q96H12 275 aa12.14□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 TSSK6Q9BXA6 273 aa12.14□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 TMEM27Q9HBJ8 222 aa12.14□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 ALPK2Q86TB3 2170 aa12.14□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 CASC3O15234 703 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 CD36P16671 472 aa12.13□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 CHMP24386 653 aa12.13□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 DMWDQ09019 674 aa12.13□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 LYSMD4Q5XG99 296 aa12.13□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 GALNT15Q8N3T1 639 aa12.13□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa12.13□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 TBX5Q99593 518 aa12.13□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 FBXO34Q9NWN3 711 aa12.13□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 SLC22A7Q9Y694 548 aa12.13□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa12.13□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 RGS5O15539 181 aa12.13□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 NR1D2Q14995 579 aa12.13□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 LRIT3Q3SXY7 679 aa12.13□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 DCST2Q5T1A1 773 aa12.13□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 EGLN3Q9H6Z9 239 aa12.13□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa12.13□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 SLC7A7Q9UM01 511 aa12.13□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 PLCL2Q9UPR0 1127 aa12.13□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 RP1P56715 2156 aa12.13□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 DNAJB5O75953 348 aa12.13□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 NADKO95544 446 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 IFI30P13284 250 aa12.13□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 RPL4P36578 427 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 STT3AP46977 705 aa12.13□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 E2F2Q14209 437 aa12.13□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 SEC23BQ15437 767 aa12.13□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 P2RY8Q86VZ1 359 aa12.13□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 ENTHD1Q8IYW4 607 aa12.13□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 OR4D11Q8NGI4 311 aa12.13□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 OR51Q1Q8NH59 317 aa12.13□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 SLC38A2Q96QD8 506 aa12.13□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 FUNDC2Q9BWH2 189 aa12.13□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 OR51V1Q9H2C8 321 aa12.13□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 MARCH7Q9H992 704 aa12.13□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 ZNF639Q9UID6 485 aa12.13□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 SERTAD3Q9UJW9 196 aa12.13□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 POMT2Q9UKY4 750 aa12.13□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa12.13□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 ERGIC3Q9Y282 383 aa12.13□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 FAAHO00519 579 aa12.12□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 NME1P15531 152 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 FOXL2P58012 376 aa12.12□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 IL18R1Q13478 541 aa12.12□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 GRM7Q14831 915 aa12.12□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 TRAM2Q15035 370 aa12.12□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 NSDHLQ15738 373 aa12.12□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 ENTPD8Q5MY95 495 aa12.12□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 SLC30A6Q6NXT4 461 aa12.12□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 TMEM203Q969S6 136 aa12.12□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa12.12□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 DEPDC7Q96QD5 511 aa12.12□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 Q9N2J8 555 aa12.12□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 MGAT4BQ9UQ53 548 aa12.12□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa12.12□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa12.12□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 ATE1O95260 518 aa12.12□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 MYL12AP19105 171 aa12.12□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 TIGD6Q17RP2 521 aa12.12□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 ADPRMQ3LIE5 342 aa12.12□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 C14orf28Q4W4Y0 310 aa12.12□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 FCRLBQ6BAA4 426 aa12.12□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 SLC36A4Q6YBV0 504 aa12.12□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 SLCO6A1Q86UG4 719 aa12.12□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 CA13Q8N1Q1 262 aa12.12□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 OR52L1Q8NGH7 329 aa12.12□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 ZNF563Q8TA94 476 aa12.12□□□□□ -0.47
HPS1-201ENST00000325103 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.2 ms