RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283882.3

CFDP1-201, Transcript of craniofacial development protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CFDP1, Length 1,275 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1-201ENST00000283882 AQP1P29972 269 aa11.6□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 LCN1P31025 176 aa11.6□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 PPICP45877 212 aa11.6□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 GPR143P51810 404 aa11.6□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 CLDN6P56747 220 aa11.6□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 CYP27C1Q4G0S4 372 aa11.6□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 GPAT3Q53EU6 434 aa11.6□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 IFI44LQ53G44 452 aa11.6□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 SFT2D3Q587I9 215 aa11.6□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 FRRS1Q6ZNA5 592 aa11.6□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 LANCL3Q6ZV70 420 aa11.6□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 PRSS58Q8IYP2 241 aa11.6□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 LILRA2Q8N149 483 aa11.6□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 GALNT15Q8N3T1 639 aa11.6□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 CATSPER1Q8NEC5 780 aa11.6□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 OR8K3Q8NH51 312 aa11.6□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 FAM110BQ8TC76 370 aa11.6□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 GPR151Q8TDV0 419 aa11.6□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa11.6□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 NACC2Q96BF6 587 aa11.6□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 COL21A1Q96P44 957 aa11.6□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 SDF2Q99470 211 aa11.6□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 SEPHS2Q99611 448 aa11.6□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 LPAR4Q99677 370 aa11.6□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 PKP2Q99959 881 aa11.6□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 EVA1AQ9H8M9 152 aa11.6□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 C8orf4Q9NR00 106 aa11.6□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 THSD1Q9NS62 852 aa11.6□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 IFT52Q9Y366 437 aa11.6□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 WDR45Q9Y484 360 aa11.6□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 KCNE3Q9Y6H6 103 aa11.6□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 FRG2CA6NGY1 282 aa11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 C21orf140B9A014 251 aa11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 DLL1O00548 723 aa11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 TO15178 435 aa11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 ACOX3O15254 700 aa11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 PEX1O43933 1283 aa11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 TIPRLO75663 272 aa11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 LDLRP01130 860 aa11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 ALPPP05187 535 aa11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 FABP3P05413 133 aa11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 UMODP07911 640 aa11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 THBS1P07996 1170 aa11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 CT45A8P0DMV1 189 aa11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 CT45A9P0DMV2 189 aa11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 DRD5P21918 477 aa11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 PRKAR1BP31321 381 aa11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 PIGAP37287 484 aa11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 VHLP40337 213 aa11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 FOLR3P41439 243 aa11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 KCNJ5P48544 419 aa11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 KCNJ10P78508 379 aa11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 KCNC4Q03721 635 aa11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP11.59□□□□□ -0.554e-7■■■□□ 18.7
CFDP1-201ENST00000283882 GK3PQ14409 553 aa11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 EBPQ15125 230 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 ZSWIM7Q19AV6 140 aa11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 CT45A2Q5DJT8 189 aa11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 C3orf38Q5JPI3 329 aa11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 NPSR1Q6W5P4 371 aa11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 GALNT10Q86SR1 603 aa11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 ZNF619Q8N2I2 560 aa11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 B3GNT7Q8NFL0 401 aa11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 LRTOMTQ8WZ04 291 aa11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 VMP1Q96GC9 406 aa11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 C7orf34Q96L11 122 aa11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 PHOX2BQ99453 314 aa11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 G6PC3Q9BUM1 346 aa11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 PINK1Q9BXM7 581 aa11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 ITPAQ9BY32 194 aa11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 OR8D2Q9GZM6 311 aa11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 DNAJB9Q9UBS3 223 aa11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 SEC14L3Q9UDX4 400 aa11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 V9GYQ6 96 aa11.59□□□□□ -0.55
CFDP1-201ENST00000283882 PMS2P1A4D2B8 440 aa11.58□□□□□ -0.56
CFDP1-201ENST00000283882 CLOCKO15516 846 aa11.58□□□□□ -0.56
CFDP1-201ENST00000283882 KCNK2O95069 426 aa11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms