RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 ESAMQ96AP7 390 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 WDR34Q96EX3 536 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 GPR22Q99680 433 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 MS4A8Q9BY19 250 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 PARD6BQ9BYG5 372 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 EHD1Q9H4M9 534 aa14.67□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 GPR52Q9Y2T5 361 aa14.67□□□□□ -0.06
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SPCS1-201ENST00000233025 CDKL4Q5MAI5 379 aa14.66□□□□□ -0.06
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SPCS1-201ENST00000233025 TCAIMQ8N3R3 496 aa14.66□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 PDPRQ8NCN5 879 aa14.66□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa14.66□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
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SPCS1-201ENST00000233025 DNAJC11Q9NVH1 559 aa14.66□□□□□ -0.06
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SPCS1-201ENST00000233025 GPR75O95800 540 aa14.65□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 CT62P0C5K7 136 aa14.65□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC166P0CW27 439 aa14.65□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 GPX3P22352 226 aa14.65□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 BSPH1Q075Z2 132 aa14.65□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 DOC2AQ14183 400 aa14.65□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 CR1LQ2VPA4 569 aa14.65□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 C11orf71Q6IPW1 123 aa14.65□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 NUP54Q7Z3B4 507 aa14.65□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 HTRA1Q92743 480 aa14.65□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 S100PBPQ96BU1 408 aa14.65□□□□□ -0.06
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SPCS1-201ENST00000233025 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa14.65□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 CXorf21Q9HAI6 301 aa14.65□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 FAIMQ9NVQ4 179 aa14.65□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 MS4A12Q9NXJ0 267 aa14.65□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 GRHL1Q9NZI5 618 aa14.65□□□□□ -0.06
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SPCS1-201ENST00000233025 CCDC151A5D8V7 595 aa14.64□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 FAM159BA6NKW6 160 aa14.64□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 UGT2B11O75310 529 aa14.64□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 VENTXO95231 258 aa14.64□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 IL11P20809 199 aa14.64□□□□□ -0.07
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SPCS1-201ENST00000233025 SSR2P43308 183 aa14.64□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 SLC12A2P55011 1212 aa14.64□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 HMGCS1Q01581 520 aa14.64□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 NNATQ16517 81 aa14.64□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 PDK4Q16654 411 aa14.64□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 AP5B1Q2VPB7 878 aa14.64□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 SULT1C3Q6IMI6 304 aa14.64□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 PYROXD1Q8WU10 500 aa14.64□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 OMA1Q96E52 524 aa14.64□□□□□ -0.07
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SPCS1-201ENST00000233025 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
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SPCS1-201ENST00000233025 OR10A5Q9H207 317 aa14.64□□□□□ -0.07
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SPCS1-201ENST00000233025 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
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SPCS1-201ENST00000233025 FESP07332 822 aa14.63□□□□□ -0.07
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SPCS1-201ENST00000233025 GPX6P59796 221 aa14.63□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 ATP6V0D1P61421 351 aa14.63□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 SLAMF1Q13291 335 aa14.63□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 TAB1Q15750 504 aa14.63□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 WDR93Q6P2C0 686 aa14.63□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 BEND4Q6ZU67 534 aa14.63□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 GPR180Q86V85 440 aa14.63□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 SNX31Q8N9S9 440 aa14.63□□□□□ -0.07
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