RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000022224.15

Trappc13-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc13, Length 2,342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Gpr61Q8C010 449 aa7.4□□□□□ -1.22
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Snx16Q8C080 344 aa7.4□□□□□ -1.22
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Gpr158Q8C419 1200 aa7.4□□□□□ -1.22
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Nt5dc1Q8C5P5 467 aa7.4□□□□□ -1.22
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Steap3Q8CI59 488 aa7.4□□□□□ -1.22
Trappc13-201ENSMUST00000022224 GmdsQ8K0C9 372 aa7.4□□□□□ -1.22
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Plac9Q8K262 108 aa7.4□□□□□ -1.22
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Gulp1Q8K2A1 304 aa7.4□□□□□ -1.22
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Rbm12Q8R4X3 992 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
Trappc13-201ENSMUST00000022224 DutQ8VCG1 200 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Zfyve21Q8VCM3 234 aa7.4□□□□□ -1.22
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Rnf130Q8VEM1 419 aa7.4□□□□□ -1.22
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Olfr700Q8VFM5 316 aa7.4□□□□□ -1.22
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Olfr353Q8VGK0 311 aa7.4□□□□□ -1.22
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Olfr1414Q8VGU5 312 aa7.4□□□□□ -1.22
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Olfr561Q8VGZ6 314 aa7.4□□□□□ -1.22
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Olfr586Q8VH13 317 aa7.4□□□□□ -1.22
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Acsm1Q91VA0 573 aa7.4□□□□□ -1.22
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Pskh1Q91YA2 424 aa7.4□□□□□ -1.22
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Oosp1Q925U0 202 aa7.4□□□□□ -1.22
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Prdm9Q96EQ9 843 aa7.4□□□□□ -1.22
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Slc22a30Q96LX3 552 aa7.4□□□□□ -1.22
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Ms4a6dQ99N07 247 aa7.4□□□□□ -1.22
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Mrpl54Q9CPW3 135 aa7.4□□□□□ -1.22
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Asf1aQ9CQE6 204 aa7.4□□□□□ -1.22
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Slc25a30Q9CR58 291 aa7.4□□□□□ -1.22
Trappc13-201ENSMUST00000022224 2310003L06RikQ9CV82 495 aa7.4□□□□□ -1.22
Trappc13-201ENSMUST00000022224 CenpnQ9CZW2 337 aa7.4□□□□□ -1.22
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Ift27Q9D0P8 186 aa7.4□□□□□ -1.22
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Senp8Q9D2Z4 221 aa7.4□□□□□ -1.22
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Mgat4dQ9D4R2 373 aa7.4□□□□□ -1.22
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Rnase10Q9D5A9 208 aa7.4□□□□□ -1.22
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Tceal6Q9DB24 200 aa7.4□□□□□ -1.22
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Aif1lQ9EQX4 150 aa7.4□□□□□ -1.22
Trappc13-201ENSMUST00000022224 P2ry14Q9ESG6 338 aa7.4□□□□□ -1.22
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Psmg2Q9EST4 264 aa7.4□□□□□ -1.22
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Sppl2aQ9JJF9 523 aa7.4□□□□□ -1.22
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Clec1bQ9JL99 229 aa7.4□□□□□ -1.22
Trappc13-201ENSMUST00000022224 March7Q9WV66 693 aa7.4□□□□□ -1.22
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Creb3l1Q9Z125 519 aa7.4□□□□□ -1.22
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Scn5aQ9JJV9 2019 aa7.4□□□□□ -1.22
Trappc13-201ENSMUST00000022224 CroccQ8CJ40 2009 aa7.4□□□□□ -1.22
Trappc13-201ENSMUST00000022224 MgamB5THE2 1827 aa7.4□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Trav1A0A075B5Z4 110 aa7.4□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 BC024063A0A1W2P7G7 749 aa7.4□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Gm5072A2AHM1 344 aa7.4□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 RerglB2RVE2 204 aa7.4□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Hs3st4D3YVV6 449 aa7.4□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Serpina3jD3Z451 420 aa7.4□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Vmn1r77E9PY60 306 aa7.4□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 OsmrO70458 971 aa7.4□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 GcatO88986 416 aa7.4□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Hoxa6P09092 232 aa7.4□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Serpine1P22777 402 aa7.4□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Htr3aP23979 487 aa7.4□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Tacr2P30549 384 aa7.4□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Acod1P54987 488 aa7.4□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Slc1a3P56564 543 aa7.4□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Tbx4P70325 552 aa7.4□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 IgfalsP70389 603 aa7.4□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Serpina3mQ03734 418 aa7.4□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Tmem38aQ3TMP8 298 aa7.4□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Rars2Q3U186 578 aa7.4□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 AktipQ64362 292 aa7.4□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 SrmQ64674 302 aa7.4□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Trim46Q7TNM2 759 aa7.4□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Olfr320Q7TRZ4 306 aa7.4□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Ap4e1Q80V94 1122 aa7.4□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Plekha8Q80W71 519 aa7.4□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Slc26a11Q80ZD3 593 aa7.4□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Cpeb2Q812E0 521 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Peli2Q8BST6 419 aa7.4□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Gpr157Q8C206 330 aa7.4□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Ccdc187Q8C5V8 958 aa7.4□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Pramef8Q8CE24 480 aa7.4□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Q8CF31 99 aa7.4□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Olfr599Q8VG01 315 aa7.4□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Olfr812Q8VG64 310 aa7.4□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Acsl6Q91WC3 697 aa7.4□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Rab28Q99KL7 221 aa7.4□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Fis1Q9CQ92 152 aa7.4□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Ccdc3Q9D6Y1 273 aa7.4□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Rhox2dW4VSN9 191 aa7.4□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 A0A286YDU1 74 aa7.39□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Catsperg1E9Q355 1151 aa7.39□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Vmn2r56E9Q4U5 779 aa7.39□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Olfr521E9Q519 321 aa7.39□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Vmn1r25H3BLP0 302 aa7.39□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 EllO08856 602 aa7.39□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Cops3O88543 423 aa7.39□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Mtnd5P03921 607 aa7.39□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Zp2P20239 713 aa7.39□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Pcsk2P21661 637 aa7.39□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Nsg2P47759 171 aa7.39□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Fosl1P48755 273 aa7.39□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Hnrnpa1P49312 320 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 ArntP53762 791 aa7.39□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 CtskP55097 329 aa7.39□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 PtpaP58389 323 aa7.39□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Hrh3P58406 445 aa7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.7 ms