RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 ZNHIT1O43257 154 aa22.82■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 HPCAL1P37235 193 aa22.82■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 IL23RQ5VWK5 629 aa22.82■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa22.82■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 BICRALQ6AI39 1079 aa22.82■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 NPSR1Q6W5P4 371 aa22.82■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 DOLPP1Q86YN1 238 aa22.82■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 SLC35A4Q96G79 324 aa22.82■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 CCDC120Q96HB5 630 aa22.82■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 ABCB7O75027 752 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 UGT2B11O75310 529 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 NME6O75414 186 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 PDE9AO76083 593 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 RFPL3SP0C7P2 107 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 PSG6Q00889 435 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 EMX2Q04743 252 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 SNTA1Q13424 505 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 PTGR1Q14914 329 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 SLC10A1Q14973 349 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 AGBL2Q5U5Z8 902 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 TMEM198Q66K66 360 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 TRILQ7L0X0 811 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 TMBIM1Q969X1 311 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 ASIC5Q9NY37 505 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 B4GALT7Q9UBV7 327 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 OR14I1A6ND48 311 aa22.8■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 SUSD5O60279 629 aa22.8■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 TSPAN2O60636 221 aa22.8■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 CELA3AP09093 270 aa22.8■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 HSPB3Q12988 150 aa22.8■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 PACS2Q86VP3 889 aa22.8■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 TMEM41AQ96HV5 264 aa22.8■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 NODALQ96S42 347 aa22.8■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 NTMQ9P121 344 aa22.8■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 MEMO1Q9Y316 297 aa22.8■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 LIPGQ9Y5X9 500 aa22.8■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 HCN1O60741 890 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 MANFP55145 182 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 MLC1Q15049 377 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 FNDC7Q5VTL7 733 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 SLC30A6Q6NXT4 461 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 LRRC34Q8IZ02 419 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 EID3Q8N140 333 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 COL21A1Q96P44 957 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 PHF12Q96QT6 1004 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 METTL7AQ9H8H3 244 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 ACKR4Q9NPB9 350 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 UNC79Q9P2D8 2635 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 TTC36A6NLP5 189 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 AQP7O14520 342 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 SNNO75324 88 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 REM1O75628 298 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 CLDN1O95832 211 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 TPOP07202 933 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 GPC1P35052 558 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 PNLIPRP2P54317 469 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 C21orf58P58505 322 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 CYP27C1Q4G0S4 372 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 DESI1Q6ICB0 168 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 RPTNQ6XPR3 784 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 CD163Q86VB7 1156 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 RIMKLAQ8IXN7 391 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 NATD1Q8N6N6 113 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 OR7A2PQ8NGA2 310 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 MGARPQ8TDB4 240 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 TMCO6Q96DC7 493 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 UBQLN3Q9H347 655 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 AKTIPQ9H8T0 292 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 THAP1Q9NVV9 213 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 OR10H1Q9Y4A9 318 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 NAV2Q8IVL1 2488 aa22.78■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 A1L4Q6 167 aa22.78■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 E9PLN8 166 aa22.78■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 PRPS1L1P21108 318 aa22.78■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 KRT20P35900 424 aa22.78■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 PTGDSP41222 190 aa22.78■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 EFR3AQ14156 821 aa22.78■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 COQ8BQ96D53 544 aa22.78■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 ADOQ96SZ5 270 aa22.78■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 VKORC1Q9BQB6 163 aa22.78■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 OSBPL11Q9BXB4 747 aa22.78■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 ATAD3AQ9NVI7 634 aa22.78■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 MED12Q93074 2177 aa22.77■■□□□ 1.24
PMS1-220ENST00000618056 PRAMEF25A6NGN4 478 aa22.77■■□□□ 1.24
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