RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF225Q9UK10 706 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 FBXL2Q9UKC9 423 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 UTS2RQ9UKP6 389 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 WIF1Q9Y5W5 379 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 A8MXE2 369 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 PLOD2O00469 737 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 ABCB7O75027 752 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 CT45A8P0DMV1 189 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 CT45A9P0DMV2 189 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 SERPINB9P50453 376 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 CLDN18P56856 261 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 ETF1P62495 437 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 CT45A2Q5DJT8 189 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF628Q5EBL2 1059 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 FAM219BQ5XKK7 198 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 SYT10Q6XYQ8 523 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM151AQ8N4L1 468 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 ADOQ96SZ5 270 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 HBEGFQ99075 208 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 ANKRA2Q9H9E1 313 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 VPS29Q9UBQ0 182 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 TRPS1Q9UHF7 1281 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 TSPAN2O60636 221 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 TNFSF13O75888 250 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 SBK3P0C264 359 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF708P17019 499 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 DIO3P55073 304 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 C8orf74Q6P047 294 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC116Q8IYX3 515 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 ERP27Q96DN0 273 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 C18orf12Q96KH6 178 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 SFXN2Q96NB2 322 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 PAFAH2Q99487 392 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 SMR3AQ99954 134 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 PACSIN3Q9UKS6 424 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 A8MT66 165 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 CASKO14936 926 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 ZIC3O60481 467 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 HSD17B3P37058 310 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 CORO7P57737 925 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 LTBQ06643 244 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 OR5M10Q6IEU7 315 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 TAOK1Q7L7X3 1001 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 RNF138Q8WVD3 245 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 DTNBP1Q96EV8 351 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 VSTM2LQ96N03 204 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 NDRG3Q9UGV2 375 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 MCM8Q9UJA3 840 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRF-216ENST00000617451 B4DXG7 233 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 MANBAO00462 879 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 HCRTR2O43614 444 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 NME6O75414 186 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 OR4F21O95013 312 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 ESRRBO95718 433 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 TGM6O95932 706 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 HSD3B1P14060 373 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 HSD3B2P26439 372 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 GAS1P54826 345 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 EFR3AQ14156 821 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 BCL2A1Q16548 175 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 OR9A2Q8NGT5 310 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 KAT2AQ92830 837 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 PFDN4Q9NQP4 134 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 TESMINQ9Y4I5 508 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1W2PNV4 684 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 MSTNO14793 375 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 IL3P08700 152 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 INHBBP09529 407 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 GRK2P25098 689 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 PSPHP78330 225 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 CLCQ05315 142 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 NPSR1Q6W5P4 371 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP22.56■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 CDYL2Q8N8U2 506 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF180Q9UJW8 692 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 DKKL1Q9UK85 242 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 TRIM49D1C9J1S8 452 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 KRT6AP02538 564 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 KRT6BP04259 564 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 CRHP06850 196 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 CHN1P15882 459 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 DPP4P27487 766 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 KRT20P35900 424 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRF-216ENST00000617451 KRT6CP48668 564 aa22.55■■□□□ 1.2
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