RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600026.5

LTBP4-227, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, human

TSL 3

Gene LTBP4, Length 723 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LTBP4-227	ENST00000600026	TTC36	A6NLP5	189 aa		20.32	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	PSMG1	O95456	288 aa		20.32	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	MATN1	P21941	496 aa		20.32	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	SLC6A2	P23975	617 aa		20.32	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	CPOX	P36551	454 aa		20.32	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	KHK	P50053	298 aa		20.32	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	MTPN	P58546	118 aa		20.32	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	LY6D	Q14210	128 aa		20.32	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	20.32	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	EBP	Q15125	230 aa	Known RBP	20.32	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	20.32	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	MEP1A	Q16819	746 aa		20.32	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		20.32	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		20.32	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	20.32	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	RNF130	Q86XS8	419 aa		20.32	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	LGI4	Q8N135	537 aa		20.32	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		20.32	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	20.32	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	ZNF354B	Q96LW1	612 aa		20.32	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	20.32	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		20.32	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		20.32	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		20.32	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		20.32	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		20.32	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	PCDHGB7	Q9Y5F8	929 aa		20.32	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		20.32	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		20.31	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	CRAT	P43155	626 aa		20.31	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	EMD	P50402	254 aa		20.31	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	MLF1	P58340	268 aa		20.31	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	FADD	Q13158	208 aa		20.31	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	RGN	Q15493	299 aa		20.31	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	RABL3	Q5HYI8	236 aa		20.31	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	ACER2	Q5QJU3	275 aa		20.31	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		20.31	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		20.31	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		20.31	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	20.31	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	BEST3	Q8N1M1	668 aa		20.31	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		20.31	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		20.31	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	NUBPL	Q8TB37	319 aa		20.31	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		20.31	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	JADE3	Q92613	823 aa		20.31	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		20.31	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	GIMAP5	Q96F15	307 aa		20.31	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	GAL3ST4	Q96RP7	486 aa		20.31	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	LMF1	Q96S06	567 aa		20.31	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		20.31	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	WWTR1	Q9GZV5	400 aa		20.31	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	20.31	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	ADA2	Q9NZK5	511 aa		20.31	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	DUXA	A6NLW8	204 aa		20.3	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	20.3	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	SOX30	O94993	753 aa		20.3	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	ALOX5	P09917	674 aa		20.3	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	GPX2	P18283	190 aa		20.3	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	SLC7A2	P52569	658 aa		20.3	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	NCALD	P61601	193 aa		20.3	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	SELPLG	Q14242	412 aa		20.3	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	20.3	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	CDC73	Q6P1J9	531 aa		20.3	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	20.3	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		20.3	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		20.3	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		20.3	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	SLC9A6	Q92581	669 aa		20.3	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		20.3	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		20.3	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	OR51I1	Q9H343	314 aa		20.3	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		20.3	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	C2orf92	A0A1B0GVN3	265 aa		20.29	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	AGR2	O95994	175 aa		20.29	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	SFTPC	P11686	197 aa		20.29	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	20.29	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	CASP9	P55211	416 aa		20.29	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	DCAF7	P61962	342 aa		20.29	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	20.29	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	20.29	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		20.29	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		20.29	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	CDRT15	Q96T59	188 aa		20.29	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	20.29	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	ITPA	Q9BY32	194 aa		20.29	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		20.29	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		20.29	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	CMTM6	Q9NX76	183 aa		20.29	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	20.29	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	STMN3	Q9NZ72	180 aa		20.29	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	ABI3	Q9P2A4	366 aa		20.29	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		20.29	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	MYOT	Q9UBF9	498 aa		20.29	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	20.29	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		20.29	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	BSN	Q9UPA5	3926 aa		20.29	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	WWP2	O00308	870 aa		20.28	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	ASNA1	O43681	348 aa		20.28	■□□□□ 0.84
LTBP4-227	ENST00000600026	ITGA10	O75578	1167 aa		20.28	■□□□□ 0.84

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