RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM83EQ2M2I3 478 aa3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 IFI44LQ53G44 452 aa3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 TECRLQ5HYJ1 363 aa3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 SIRPB2Q5JXA9 342 aa3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 Q5PR19 223 aa3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 METTL21CQ5VZV1 264 aa3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 TPGS2Q68CL5 300 aa3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 SEL1L3Q68CR1 1132 aa3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 FCRLBQ6BAA4 426 aa3.9□□□□□ -1.79
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CAPNS1-210ENST00000590211 NEPROQ6NW34 567 aa3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 EPGNQ6UW88 154 aa3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa3.9□□□□□ -1.79
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CAPNS1-210ENST00000590211 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC22A9Q8IVM8 553 aa3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 ELMOD2Q8IZ81 293 aa3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF781Q8N8C0 355 aa3.9□□□□□ -1.79
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CAPNS1-210ENST00000590211 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
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CAPNS1-210ENST00000590211 IGSF21Q96ID5 467 aa3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 PANX3Q96QZ0 392 aa3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 SIGLEC11Q96RL6 698 aa3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 PKP2Q99959 881 aa3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 KXD1Q9BQD3 176 aa3.9□□□□□ -1.79
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CAPNS1-210ENST00000590211 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 S1PR5Q9H228 398 aa3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 MFSD1Q9H3U5 465 aa3.9□□□□□ -1.79
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CAPNS1-210ENST00000590211 EBF2Q9HAK2 575 aa3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 PDFQ9HBH1 243 aa3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 CDH20Q9HBT6 801 aa3.9□□□□□ -1.79
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CAPNS1-210ENST00000590211 TCF7L2Q9NQB0 619 aa3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 TAS2R1Q9NYW7 299 aa3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 NPAP1Q9NZP6 1156 aa3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 FBXL2Q9UKC9 423 aa3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 GPR132Q9UNW8 380 aa3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 C15orf41Q9Y2V0 281 aa3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa3.9□□□□□ -1.79
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CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
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CAPNS1-210ENST00000590211 A8MT66 165 aa3.89□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 MEI4A8MW99 385 aa3.89□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF195O14628 629 aa3.89□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC22A2O15244 555 aa3.89□□□□□ -1.79
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CAPNS1-210ENST00000590211 KDELR3O43731 214 aa3.89□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 NDUFS7O75251 213 aa3.89□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 SMIM24O75264 130 aa3.89□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 TM7SF2O76062 418 aa3.89□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 GJB5O95377 273 aa3.89□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 PSMG1O95456 288 aa3.89□□□□□ -1.79
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CAPNS1-210ENST00000590211 PLGP00747 810 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 ADRB1P08588 477 aa3.89□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 SBK2P0C263 348 aa3.89□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 SAGP10523 405 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 ARRB2P32121 409 aa3.89□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 ACVRL1P37023 503 aa3.89□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 RPL14P50914 215 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 CTSCP53634 463 aa3.89□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 MTCP1P56278 107 aa3.89□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 TAS2R39P59534 338 aa3.89□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 NHLH1Q02575 133 aa3.89□□□□□ -1.79
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CAPNS1-210ENST00000590211 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 CUL3Q13618 768 aa3.89□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 GAMTQ14353 236 aa3.89□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 GCNT6Q5T4J0 391 aa3.89□□□□□ -1.79
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