RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583667.1

GGA3-217, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 4

Gene GGA3, Length 531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-217	ENST00000583667	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	GIMAP5	Q96F15	307 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	OR1F2P	Q96R84	312 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	CUTC	Q9NTM9	273 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	LIPT1	Q9Y234	373 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	TP53TG5	Q9Y2B4	290 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	ZNF860	A6NHJ4	632 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667		D6RAR5	112 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	UPK1A	O00322	258 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	DSCR3	O14972	297 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	NKX2-8	O15522	239 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	ZNF749	O43361	778 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	FGF17	O60258	216 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	PDE9A	O76083	593 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	FOLR1	P15328	257 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	MATN1	P21941	496 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	PEX2	P28328	305 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	MAP3K8	P41279	467 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	KHK	P50053	298 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	OLR1	P78380	273 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	DSG2	Q14126	1118 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	MAPK11	Q15759	364 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	LPCAT4	Q643R3	524 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	GPR135	Q8IZ08	494 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	SLC34A3	Q8N130	599 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	NUP43	Q8NFH3	380 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	OR1L3	Q8NH93	324 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	FBXO30	Q8TB52	745 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	PMM1	Q92871	262 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	MAL2	Q969L2	176 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	PPWD1	Q96BP3	646 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	C7orf34	Q96L11	122 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	SEPHS2	Q99611	448 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	PELO	Q9BRX2	385 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	DOHH	Q9BU89	302 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	NTN4	Q9HB63	628 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	FANCE	Q9HB96	536 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	FGF21	Q9NSA1	209 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	PADI2	Q9Y2J8	665 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667		A0A0G2JPF8	293 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667		A0A1W2PS29	197 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	TMEM247	A6NEH6	219 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	TTLL8	A6PVC2	850 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	TMEM150C	B9EJG8	249 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	FAM227A	F5H4B4	570 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	STMND1	H3BQB6	276 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667		M0QX08	132 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	ACOX3	O15254	700 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	PGM3	O95394	542 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	ETS2	P15036	469 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	ATP6V1C1	P21283	382 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	RORA	P35398	523 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	SOX11	P35716	441 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	HSPA13	P48723	471 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	SEPHS1	P49903	392 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	TP53BP2	Q13625	1128 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	SERTAD2	Q14140	314 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	GK3P	Q14409	553 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	GPR19	Q15760	415 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	CDC73	Q6P1J9	531 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-217	ENST00000583667	TMEM107	Q6UX40	140 aa		11.12	□□□□□ -0.63

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