RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa20.27■□□□□ 0.84
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PTPRM-211ENST00000580170 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 CACNG6Q9BXT2 260 aa20.27■□□□□ 0.84
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PTPRM-211ENST00000580170 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa20.27■□□□□ 0.84
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PTPRM-211ENST00000580170 UNC5DQ6UXZ4 953 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRM-211ENST00000580170 ARL14Q8N4G2 192 aa20.27■□□□□ 0.84
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PTPRM-211ENST00000580170 TMEM181Q9P2C4 612 aa20.27■□□□□ 0.84
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PTPRM-211ENST00000580170 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa20.26■□□□□ 0.83
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PTPRM-211ENST00000580170 DCTP40126 519 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 SELENOWP63302 87 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 SLC18B1Q6NT16 456 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 TLDC1Q6P9B6 456 aa20.25■□□□□ 0.83
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