RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574234.1

TRIM25-208, Transcript of tripartite motif containing 25, human

TSL 2

Gene TRIM25, Length 471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRIM25-208	ENST00000574234	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	SERPINC1	P01008	464 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	ELANE	P08246	267 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	ATP6V1B1	P15313	513 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	IL10	P22301	178 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	PCK1	P35558	622 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	AVPR1B	P47901	424 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	MTNR1A	P48039	350 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	ACTG1	P63261	375 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	EFNB1	P98172	346 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	RHAG	Q02094	409 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	PCLAF	Q15004	111 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	NSDHL	Q15738	373 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	NTRK2	Q16620	822 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	HKDC1	Q2TB90	917 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	WDR93	Q6P2C0	686 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	DTX2	Q86UW9	622 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	NAT14	Q8WUY8	206 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	GLMP	Q8WWB7	406 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	NELFB	Q8WX92	580 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	ULK4	Q96C45	1275 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	KLHL15	Q96M94	604 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	WDFY2	Q96P53	400 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	COPS8	Q99627	209 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	TEX12	Q9BXU0	123 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	DEFB126	Q9BYW3	111 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	PIGM	Q9H3S5	423 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	EXO5	Q9H790	373 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234		A0A0G2JMM0	328 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	ATP6AP2	A0A1C7CYW4	349 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234		A0A1W2PPB8	328 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234		A0A1W2PRS3	328 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	MROH6	A6NGR9	719 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	SAGE2P	A6NJ88	616 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234		A8MZ25	164 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	EPHB6	O15197	1021 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	ATP6AP2	O75787	350 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	EPO	P01588	193 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	IGHV4-39	P01824	125 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	KRT1	P04264	644 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	RPN2	P04844	631 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	UCHL3	P15374	230 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	CNR1	P21554	472 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	GATA3	P23771	443 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	PRPH2	P23942	346 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	ADRA1D	P25100	572 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	ATP5D	P30049	168 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	TTK	P33981	857 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	XCR1	P46094	333 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	SSR4	P51571	173 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	RPS6KA3	P51812	740 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	DIO3	P55073	304 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	OR4D2	P58180	307 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	RELA	Q04206	551 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	GRB7	Q14451	532 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	PDK1	Q15118	436 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	NDUFA9	Q16795	377 aa		4.64	□□□□□ -1.67

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