RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568870.1

TCF25-223, Transcript of transcription factor 25, human

TSL 2

Gene TCF25, Length 263 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF25-223	ENST00000568870	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TCF25-223	ENST00000568870	WDPCP	O95876	746 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF25-223	ENST00000568870	CT45A8	P0DMV1	189 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF25-223	ENST00000568870	CT45A9	P0DMV2	189 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF25-223	ENST00000568870	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TCF25-223	ENST00000568870	KRT20	P35900	424 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF25-223	ENST00000568870	SOX3	P41225	446 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF25-223	ENST00000568870	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TCF25-223	ENST00000568870	ARG2	P78540	354 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF25-223	ENST00000568870	MXRA7	P84157	204 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF25-223	ENST00000568870	KRT72	Q14CN4	511 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF25-223	ENST00000568870	DUSP5	Q16690	384 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF25-223	ENST00000568870	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF25-223	ENST00000568870	COX20	Q5RI15	118 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF25-223	ENST00000568870	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	12.84	□□□□□ -0.35
TCF25-223	ENST00000568870	OPN5	Q6U736	354 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF25-223	ENST00000568870	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF25-223	ENST00000568870	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF25-223	ENST00000568870	CDS1	Q92903	461 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF25-223	ENST00000568870	TMBIM1	Q969X1	311 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF25-223	ENST00000568870	LRRC58	Q96CX6	371 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF25-223	ENST00000568870	OMA1	Q96E52	524 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF25-223	ENST00000568870	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TCF25-223	ENST00000568870	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF25-223	ENST00000568870	LMF1	Q96S06	567 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF25-223	ENST00000568870	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TCF25-223	ENST00000568870	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TCF25-223	ENST00000568870	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF25-223	ENST00000568870	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF25-223	ENST00000568870	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF25-223	ENST00000568870	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF25-223	ENST00000568870	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TCF25-223	ENST00000568870	CBLC	Q9ULV8	474 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF25-223	ENST00000568870	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF25-223	ENST00000568870	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	DUXA	A6NLW8	204 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870		A8MVJ9	347 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	EVPLL	A8MZ36	301 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	REM1	O75628	298 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	OR6B1	O95007	311 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	NKX2-2	O95096	273 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	OR12D1	P0DN82	309 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	ABCD3	P28288	659 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	IL12B	P29460	328 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	MTPN	P58546	118 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	SLC34A3	Q8N130	599 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	SLC15A4	Q8N697	577 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	TM9SF4	Q92544	642 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	TTC9	Q92623	222 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	RAB8B	Q92930	207 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	SLC35A4	Q96G79	324 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	NSL1	Q96IY1	281 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	STAC	Q99469	402 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	12.83	□□□□□ -0.36	3e-7	■□□□□ 10.4
TCF25-223	ENST00000568870	PIGU	Q9H490	435 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	EXD2	Q9NVH0	621 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	HPF1	Q9NWY4	346 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	TP53TG5	Q9Y2B4	290 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	LAMA5	O15230	3695 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	USP24	Q9UPU5	2620 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	T	O15178	435 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	NPPA	P01160	153 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	ETFA	P13804	333 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	MAP3K8	P41279	467 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	CYB561	P49447	251 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	MAN2A2	P49641	1150 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	HLCS	P50747	726 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	DSTN	P60981	165 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	PSPH	P78330	225 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	TUBA3C	Q13748	450 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	SELPLG	Q14242	412 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	RGN	Q15493	299 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	DECR1	Q16698	335 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TCF25-223	ENST00000568870	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36

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