RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558649.5

RABGGTA-206, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTA, Length 768 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-206ENST00000558649 ANKRD46Q86W74 232 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 SIAH3Q8IW03 269 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 CLECL1Q8IZS7 167 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 OR5AK3PQ8NH89 298 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 ACTRT2Q8TDY3 377 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 OR5P2Q8WZ92 322 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 SLC9A6Q92581 669 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 JADE3Q92613 823 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 TEX37Q96LM6 180 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 GPR137Q96N19 417 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 RILPQ96NA2 401 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 ADOQ96SZ5 270 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 CXorf36Q9H7Y0 433 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 Q9N2J8 555 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 KLRF1Q9NZS2 232 aa14.56□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 E9PBE3 544 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 ANKRD28O15084 1053 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 TO15178 435 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 GABRA3P34903 492 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 MAGEA5P43359 124 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 KIR3DL1P43629 444 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 MASP1P48740 699 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 AQP5P55064 265 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 SPANXN4Q5MJ08 99 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 EPGNQ6UW88 154 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 NUP54Q7Z3B4 507 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 CAMKMTQ7Z624 323 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 SLC22A16Q86VW1 577 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 NATD1Q8N6N6 113 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 OR52N2Q8NGI0 321 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 OR4A15Q8NGL6 344 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 CEP70Q8NHQ1 597 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 GPR151Q8TDV0 419 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 PIK3R3Q92569 461 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 HGDQ93099 445 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 ZNF597Q96LX8 424 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 COL21A1Q96P44 957 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 NODALQ96S42 347 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 ZBTB18Q99592 522 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 DEFB127Q9H1M4 99 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 PROK2Q9HC23 129 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 GALNT9Q9HCQ5 603 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 CBLCQ9ULV8 474 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 GPR45Q9Y5Y3 372 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 NCKAP5O14513 1909 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 GXYLT2A0PJZ3 443 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 C2orf72A6NCS6 295 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 UBDO15205 165 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 ASNA1O43681 348 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 IFI6P09912 130 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 IDO1P14902 403 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 NAGAP17050 411 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 S100A3P33764 101 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 CASP3P42574 277 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 CCT3P49368 545 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 DGKQP52824 942 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 HBA1P69905 142 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 RBPJQ06330 500 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 GAB1Q13480 694 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 VPS26BQ4G0F5 336 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 MFSD12Q6NUT3 480 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 GALNT10Q86SR1 603 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 CLEC4FQ8N1N0 589 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 TESCQ96BS2 214 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 TMCO6Q96DC7 493 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 GIMAP5Q96F15 307 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 C16orf58Q96GQ5 468 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 EBF4Q9BQW3 602 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 OSBPL11Q9BXB4 747 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 IL1RL2Q9HB29 575 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 NEUROD4Q9HD90 331 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 MED4Q9NPJ6 270 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 TCF7L2Q9NQB0 619 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 TENM4Q6N022 2769 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 PRAMEF25A6NGN4 478 aa14.53□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 OR6C70A6NIJ9 312 aa14.53□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 LRRC3CA6NJW4 275 aa14.53□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 GNB5O14775 395 aa14.53□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 TSPAN2O60636 221 aa14.53□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 GLSO94925 669 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 AGFG2O95081 481 aa14.53□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 CELA3AP09093 270 aa14.53□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 ACP2P11117 423 aa14.53□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 IL12AP29459 219 aa14.53□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 PRIM2P49643 509 aa14.53□□□□□ -0.08
RABGGTA-206ENST00000558649 IDH3AP50213 366 aa14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms