RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 RHCEP18577 417 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 AGXTP21549 392 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 IDH2P48735 452 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 CCL7P80098 99 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 NR0B2Q15466 257 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 KDM4DQ6B0I6 523 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 THAP5Q7Z6K1 395 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 C11orf74Q86VG3 221 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 AQP11Q8NBQ7 271 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 OR52P1PQ8NH57 321 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 OR4C6Q8NH72 309 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 CNIH3Q8TBE1 160 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 SGCDQ92629 289 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 DGAT2Q96PD7 388 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 CD180Q99467 661 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 PTGFRNQ9P2B2 879 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 ERVK-19Q9WJR5 959 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 DTX4Q9Y2E6 619 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 NTNG1Q9Y2I2 539 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 GMPPBQ9Y5P6 360 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 A0A0G2JPF8 293 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 GXYLT2A0PJZ3 443 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 H0YAE9 185 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 PEX12O00623 359 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 PLOD3O60568 738 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 CTNSO60931 367 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 BMP10O95393 424 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 EPPINO95925 133 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 HPRP00739 348 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 TFAP2AP05549 437 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 ALOX5P09917 674 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 PIGFQ07326 219 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 PHF19Q5T6S3 580 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 LAPTM4BQ86VI4 370 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 DTWD2Q8NBA8 298 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 BBS10Q8TAM1 723 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 MIPOL1Q8TD10 442 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 RASSF5Q8WWW0 418 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 TSLPQ969D9 159 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 SDF2Q99470 211 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 EPYCQ99645 322 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 FNDC11Q9BVV2 318 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 ZNF696Q9H7X3 374 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 ZNF556Q9HAH1 456 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 THSD1Q9NS62 852 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 USE1Q9NZ43 259 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 LIPT1Q9Y234 373 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 M0R129 80 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 XPNPEP2O43895 674 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 UGT2B17O75795 530 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 DNAJB5O75953 348 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 SOX14O95416 240 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 CPNE6O95741 557 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 CBX7O95931 251 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 GASTP01350 101 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 LINGO3P0C6S8 592 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 ETS2P15036 469 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 RPP38P78345 283 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 CD47Q08722 323 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 MGAT2Q10469 447 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 NPRL3Q12980 569 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 MICAQ29983 383 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 COLEC12Q5KU26 742 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 ARHGAP40Q5TG30 622 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 FOXB2Q5VYV0 432 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 USP51Q70EK9 711 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 OR6C4Q8NGE1 309 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 OR6C1Q96RD1 312 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 OR8D2Q9GZM6 311 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 RAB33BQ9H082 229 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 AMBNQ9NP70 447 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 NECTIN3Q9NQS3 549 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 TMCC3Q9ULS5 477 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 CYP7B1O75881 506 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 CCNB2O95067 398 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 H1F0P07305 194 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 GKN3PP0CG01 181 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 FMO3P31513 532 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 EPS8Q12929 822 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 SEC23BQ15437 767 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 MAPK14Q16539 360 aa7.84□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
CS-215ENST00000549143 RFX4Q33E94 735 aa7.84□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms