RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 ZNF227Q86WZ6 799 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 TMEM251Q8N6I4 163 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 DUSP19Q8WTR2 217 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 HAS2Q92819 552 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 RAB8BQ92930 207 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 GAL3ST3Q96A11 431 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 MCUR1Q96AQ8 359 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 GPR78Q96P69 363 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 NUF2Q9BZD4 464 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 C12orf49Q9H741 205 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 CTPS2Q9NRF8 586 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 COQ3Q9NZJ6 369 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 PCTPQ9UKL6 214 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 SLC22A7Q9Y694 548 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 A0A088AWK7 358 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 H0YIG0 161 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 GYG2O15488 501 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 IPO13O94829 963 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 ICAM2P13598 275 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 ANPEPP15144 967 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 EMP3P54852 163 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 ACAP2Q15057 778 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 SGCBQ16585 318 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 PRSS53Q2L4Q9 553 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 SPDYE7PQ495Y7 208 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 C6orf163Q5TEZ5 329 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 GARNL3Q5VVW2 1013 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 ZNF550Q7Z398 422 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 TMEM178AQ8NBL3 297 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 OR7A2PQ8NGA2 310 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 OR4K14Q8NGD5 310 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 TM4SF19Q96DZ7 209 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 WDR54Q9H977 334 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 C14orf105Q9NVL8 296 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 NDE1Q9NXR1 346 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 PRODH2Q9UF12 536 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 FCHO1O14526 889 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 DDAH2O95865 285 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 HPGDP15428 266 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 SKP1P63208 163 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 CAV1Q03135 178 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 TGM3Q08188 693 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 PLCXD2Q0VAA5 305 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 SLC22A10Q63ZE4 541 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 RINLQ6ZS11 566 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 NUDT13Q86X67 352 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 OR5D16Q8NGK9 328 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 SMR3AQ99954 134 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 TTTY12Q9BZ98 90 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 ACPTQ9BZG2 426 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 OR10A5Q9H207 317 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 VPS29Q9UBQ0 182 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 FBXL2Q9UKC9 423 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 FITM1A5D6W6 292 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 SAGE2PA6NJ88 616 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 ITM2AO43736 263 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 CTNSO60931 367 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 UGT2B11O75310 529 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 FKBP6O75344 327 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 ERGP11308 486 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 PORP16435 677 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 GABRA3P34903 492 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 AP2B1P63010 937 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 TRAF3Q13114 568 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 SP140Q13342 867 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 MARCH3Q86UD3 253 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 FNDC5Q8NAU1 212 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 FNDC8Q8TC99 324 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 FKBP10Q96AY3 582 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 VPS50Q96JG6 964 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 SIKE1Q9BRV8 207 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 IL1RL2Q9HB29 575 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 INIPQ9NRY2 104 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 ARL8BQ9NVJ2 186 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 KLHL28Q9NXS3 571 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 NUDT4Q9NZJ9 180 aa6.93□□□□□ -1.3
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