RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 CPNE6O95741 557 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 TSPAN12O95859 305 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 MT-ND5P03915 603 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 IL1RNP18510 177 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 PRPS1L1P21108 318 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 KCNQ1P51787 676 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 EMP3P54852 163 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 BCL2L1Q07817 233 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 OLIG2Q13516 323 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 GCNT6Q5T4J0 391 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 ASPGQ86U10 573 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 ISCA2Q86U28 154 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 CLRN3Q8NCR9 226 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 OR56B4Q8NH76 319 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 UBTD2Q8WUN7 234 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 TM9SF4Q92544 642 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 MOCOSQ96EN8 888 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 NTMT1Q9BV86 223 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 TVP23BQ9NYZ1 205 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 OR6C2Q9NZP2 312 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 SLC25A13Q9UJS0 675 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 GREB1Q4ZG55 1949 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 SHROOM3Q8TF72 1996 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 RFXAPO00287 272 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 GFRA2O00451 464 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 OR7A17O14581 309 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 CTDSP2O14595 271 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 WNT9AO14904 365 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 VIPP01282 170 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 GPR143P51810 404 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 LUMP51884 338 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 FBXW4P57775 412 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 MAXP61244 160 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 ST3GAL4Q11206 333 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 LIPKQ5VXJ0 399 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 CES4AQ5XG92 561 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 C22orf42Q6IC83 251 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 NAA40Q86UY6 237 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 DNAJC22Q8N4W6 341 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 OR10R2Q8NGX6 335 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 SCARB1Q8WTV0 552 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 SLC7A6Q92536 515 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 POM121Q96HA1 1249 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 HBEGFQ99075 208 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 RHBGQ9H310 441 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 GSTO2Q9H4Y5 243 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 INPP5EQ9NRR6 644 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 ACSL6Q9UKU0 697 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 RNF11Q9Y3C5 154 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 LTBP2Q14767 1821 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 STK25O00506 426 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 SEC14L5O43304 696 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 ZBTB14O43829 449 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 FZD6O60353 706 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 TBL1XO60907 577 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 TBX18O95935 607 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 JUNP05412 331 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 HOXA9P31269 272 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 CHRNA6Q15825 494 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 SPRED1Q7Z699 444 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 ANKRD46Q86W74 232 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 OR7D4Q8NG98 312 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 FIBINQ8TAL6 211 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 RSC1A1Q92681 617 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 MUL1Q969V5 352 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 LRIG1Q96JA1 1093 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF382Q96SR6 550 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 SEMA3GQ9NS98 782 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 CIB4A0PJX0 185 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 CASC3O15234 703 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 GRM6O15303 877 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 AHSA1O95433 338 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 F11P03951 625 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 CTSAP10619 480 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 CD1EP15812 388 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 SPNP16150 400 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 VAMP2P63027 116 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 SP140Q13342 867 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 GPNMBQ14956 572 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 IQCHQ86VS3 1027 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 ENTHD1Q8IYW4 607 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRD-214ENST00000540109 OR51D1Q8NGF3 324 aa5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms