RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529986.5

CTNND1-223, Transcript of catenin delta 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTNND1, Length 5,727 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTNND1-223	ENST00000529986	MICA	Q29983	383 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	SAMD8	Q96LT4	415 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	STRA6	Q9BX79	667 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	RNF32	Q9H0A6	362 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986		A8MVJ9	347 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986		M0R3H8	397 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	TSPAN6	O43657	245 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	TXNDC12	O95881	172 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	IFNA4	P05014	189 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	OSM	P13725	252 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	SELP	P16109	830 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	CLDN8	P56748	225 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	FAP	Q12884	760 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	DOC2A	Q14183	400 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	TCEAL1	Q15170	157 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	LIPJ	Q5W064	366 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	PXK	Q7Z7A4	578 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	ISCA2	Q86U28	154 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	FAM46B	Q96A09	425 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	APIP	Q96GX9	242 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	GON7	Q9BXV9	100 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	PCTP	Q9UKL6	214 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	MYH6	P13533	1939 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986		K7EPK0	472 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	FUCA1	P04066	466 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	CD6	P30203	668 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	MLLT3	P42568	568 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	FXYD4	P59646	89 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	NR4A3	Q92570	626 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	IL12RB2	Q99665	862 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	ALS2	Q96Q42	1657 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	RAB19	A4D1S5	217 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	TTLL8	A6PVC2	850 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	GMDS	O60547	372 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	PRAMEF2	O60811	474 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	CSTA	P01040	98 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	IFNA10	P01566	189 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	ADORA3	P0DMS8	318 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	TYRP1	P17643	537 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	LAG3	P18627	525 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	SLC2A5	P22732	501 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	HNF1B	P35680	557 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	POU3F4	P49335	361 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	ACTA2	P62736	377 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	ACTG2	P63267	376 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	SLAMF1	Q13291	335 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	SQSTM1	Q13501	440 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	STEAP4	Q687X5	459 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	C18orf63	Q68DL7	685 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	CPO	Q8IVL8	374 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	POC1B	Q8TC44	478 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	TOMM40L	Q969M1	308 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	MALSU1	Q96EH3	234 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	ALG8	Q9BVK2	526 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	VAPA	Q9P0L0	249 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	CIB4	A0PJX0	185 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986		I6L893	689 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	HCRTR2	O43614	444 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	PPP1R3D	O95685	299 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CTNND1-223	ENST00000529986	HRG	P04196	525 aa		7.25	□□□□□ -1.25

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