RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519751.5

MSC-AS1-206, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene MSC-AS1, Length 596 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-206ENST00000519751 OR1J4Q8NGS1 313 aa14.61□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 NEIL3Q8TAT5 605 aa14.61□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 SDCCAG3Q96C92 435 aa14.61□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 MTERF3Q96E29 417 aa14.61□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 FCRL1Q96LA6 429 aa14.61□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 VSTM2LQ96N03 204 aa14.61□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 AMDHD1Q96NU7 426 aa14.61□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 OSBPL11Q9BXB4 747 aa14.61□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 TUBB1Q9H4B7 451 aa14.61□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 REEP4Q9H6H4 257 aa14.61□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 FOLH1BQ9HBA9 442 aa14.61□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa14.61□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 C15orf41Q9Y2V0 281 aa14.61□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa14.61□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 PIP5K1BO14986 540 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 PDPK1O15530 556 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 TBX19O60806 448 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 ZWINTO95229 277 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 LRATO95237 230 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 HSPA4LO95757 839 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 CELA3AP09093 270 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 RFPL3SP0C7P2 107 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 SDC1P18827 310 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 GPC1P35052 558 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 SOX18P35713 384 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 HPCAL1P37235 193 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 MC3RP41968 323 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 ETV4P43268 484 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 SERPINB4P48594 390 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 TOMM20Q15388 145 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 CYP27C1Q4G0S4 372 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 TIGD3Q6B0B8 471 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 ZNF787Q6DD87 383 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 TMEM107Q6UX40 140 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 OR2L13Q8N349 312 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 SIMC1Q8NDZ2 872 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 OR2T11Q8NH01 316 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 AGR3Q8TD06 166 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 HGDQ93099 445 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 TMBIM1Q969X1 311 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 SLC35A4Q96G79 324 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 TSSK3Q96PN8 268 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 GLIPR2Q9H4G4 154 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 C3orf14Q9HBI5 128 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 PNPLA3Q9NST1 481 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 SH3BP4Q9P0V3 963 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 LIPGQ9Y5X9 500 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 PRAMEF25A6NGN4 478 aa14.59□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 CYSRT1A8MQ03 144 aa14.59□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 UGT2B11O75310 529 aa14.59□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 SERPINE1P05121 402 aa14.59□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 HPNP05981 417 aa14.59□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 CT45A8P0DMV1 189 aa14.59□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 CT45A9P0DMV2 189 aa14.59□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 GRK2P25098 689 aa14.59□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 TACR1P25103 407 aa14.59□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 CHRNB4P30926 498 aa14.59□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 CDK9P50750 372 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 PNLIPRP2P54317 469 aa14.59□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 GYS2P54840 703 aa14.59□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 WDR4P57081 412 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 UGT3A2Q3SY77 523 aa14.59□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 VPS26BQ4G0F5 336 aa14.59□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 CT45A2Q5DJT8 189 aa14.59□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 BICRALQ6AI39 1079 aa14.59□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa14.59□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 PM20D2Q8IYS1 436 aa14.59□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 NATD1Q8N6N6 113 aa14.59□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 OR5M9Q8NGP3 310 aa14.59□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 MGARPQ8TDB4 240 aa14.59□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 MARVELD3Q96A59 401 aa14.59□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 ELP4Q96EB1 424 aa14.59□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 EGLN2Q96KS0 407 aa14.59□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 GNRHR2Q96P88 292 aa14.59□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 ADOQ96SZ5 270 aa14.59□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 ANKRA2Q9H9E1 313 aa14.59□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 Q9N2J8 555 aa14.59□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 CROCCQ5TZA2 2017 aa14.59□□□□□ -0.07
MSC-AS1-206ENST00000519751 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa14.58□□□□□ -0.08
MSC-AS1-206ENST00000519751 TMEM233B4DJY2 109 aa14.58□□□□□ -0.08
MSC-AS1-206ENST00000519751 UPK1AO00322 258 aa14.58□□□□□ -0.08
MSC-AS1-206ENST00000519751 SNPHO15079 494 aa14.58□□□□□ -0.08
MSC-AS1-206ENST00000519751 AKAP10O43572 662 aa14.58□□□□□ -0.08
MSC-AS1-206ENST00000519751 ICOSLGO75144 302 aa14.58□□□□□ -0.08
MSC-AS1-206ENST00000519751 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
MSC-AS1-206ENST00000519751 CBR3O75828 277 aa14.58□□□□□ -0.08
MSC-AS1-206ENST00000519751 DHRS4L1P0CG22 281 aa14.58□□□□□ -0.08
MSC-AS1-206ENST00000519751 COX6B1P14854 86 aa14.58□□□□□ -0.08
MSC-AS1-206ENST00000519751 MANFP55145 182 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
MSC-AS1-206ENST00000519751 CORO7P57737 925 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms