RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514845.5

CAST-241, Transcript of calpastatin, humanhuman

TSL 4

Gene CAST, Length 588 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAST-241ENST00000514845 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 NR2F6P10588 404 aa7.5□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 COL6A2P12110 1019 aa7.5□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 NAGAP17050 411 aa7.5□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 HK1P19367 917 aa7.5□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 NT5EP21589 574 aa7.5□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 GRK2P25098 689 aa7.5□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 GALNSP34059 522 aa7.5□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 HSPA7P48741 367 aa7.5□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 COMPP49747 757 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 GAS1P54826 345 aa7.5□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 CDKL1Q00532 357 aa7.5□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 CHIT1Q13231 466 aa7.5□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP7.5□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 PRR31Q5SQ13 230 aa7.5□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 SEL1L2Q5TEA6 688 aa7.5□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 RAET1LQ5VY80 246 aa7.5□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 MFSD12Q6NUT3 480 aa7.5□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 RAD9BQ6WBX8 426 aa7.5□□□□□ -1.21
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CAST-241ENST00000514845 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 C17orf47Q8NEP4 570 aa7.5□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 ANKK1Q8NFD2 765 aa7.5□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 ADCY4Q8NFM4 1077 aa7.5□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa7.5□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 ANKRD49Q8WVL7 239 aa7.5□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 PROX1Q92786 737 aa7.5□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 TMBIM1Q969X1 311 aa7.5□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 NXNL1Q96CM4 212 aa7.5□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 WDR34Q96EX3 536 aa7.5□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 SIGLEC10Q96LC7 697 aa7.5□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 HBEGFQ99075 208 aa7.5□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 GRIP2Q9C0E4 1043 aa7.5□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 DNAJC11Q9NVH1 559 aa7.5□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 GPRC5BQ9NZH0 403 aa7.5□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 VWA7Q9Y334 891 aa7.5□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 EMC9Q9Y3B6 208 aa7.5□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 OARD1Q9Y530 152 aa7.5□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa7.5□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 WNK1Q9H4A3 2382 aa7.5□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 TMEM89A2RUT3 159 aa7.49□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 OR2M5A3KFT3 312 aa7.49□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 VWC2LB2RUY7 222 aa7.49□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 E7EQL1 145 aa7.49□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 PLGP00747 810 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 OPN1LWP04000 364 aa7.49□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 GBAP04062 536 aa7.49□□□□□ -1.21
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CAST-241ENST00000514845 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 IL11P20809 199 aa7.49□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 ADH6P28332 368 aa7.49□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 SRP14P37108 136 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
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CAST-241ENST00000514845 CTBP2P56545 445 aa7.49□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 SPOCK1Q08629 439 aa7.49□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 MGAT2Q10469 447 aa7.49□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 RAB35Q15286 201 aa7.49□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 SGCBQ16585 318 aa7.49□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 CCNG2Q16589 344 aa7.49□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 MIDNQ504T8 468 aa7.49□□□□□ -1.21
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CAST-241ENST00000514845 AGAP6Q5VW22 663 aa7.49□□□□□ -1.21
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CAST-241ENST00000514845 C4orf22Q6V702 233 aa7.49□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 B3GLCTQ6Y288 498 aa7.49□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 BEND4Q6ZU67 534 aa7.49□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 SPATA6LQ8N4H0 392 aa7.49□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 METTL25Q8N6Q8 603 aa7.49□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 C7orf57Q8NEG2 295 aa7.49□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 STEAP2Q8NFT2 490 aa7.49□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 OR2M3Q8NG83 312 aa7.49□□□□□ -1.21
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CAST-241ENST00000514845 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 GBP4Q96PP9 640 aa7.49□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 ADOQ96SZ5 270 aa7.49□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 EFCAB11Q9BUY7 163 aa7.49□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 PRRG4Q9BZD6 226 aa7.49□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 OR10A4Q9H209 315 aa7.49□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 FBXO34Q9NWN3 711 aa7.49□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 MS4A12Q9NXJ0 267 aa7.49□□□□□ -1.21
CAST-241ENST00000514845 NPAP1Q9NZP6 1156 aa7.49□□□□□ -1.21
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