RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506464.5

ABCC3-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 3, human

TSL 4

Gene ABCC3, Length 540 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCC3-208	ENST00000506464	TIGD3	Q6B0B8	471 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	RTL6	Q6ICC9	239 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464		Q6ZSR9	355 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	LACC1	Q8IV20	430 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	OR1J4	Q8NGS1	313 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	DOK4	Q8TEW6	326 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	C16orf78	Q8WTQ4	265 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	NTNG2	Q96CW9	530 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	TMCO6	Q96DC7	493 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	OMA1	Q96E52	524 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	BTBD9	Q96Q07	612 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	ITPA	Q9BY32	194 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	TAS2R9	Q9NYW1	312 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	HEY2	Q9UBP5	337 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	POLR3H	Q9Y535	204 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	TMEM114	B3SHH9	223 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	SLC28A1	O00337	649 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	PIP5K1B	O14986	540 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	RGS14	O43566	566 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	PLOD3	O60568	738 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	COQ9	O75208	318 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	TRAPPC6A	O75865	159 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	EPPIN	O95925	133 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	CBX7	O95931	251 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	ACTL6A	O96019	429 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	IFI6	P09912	130 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	LINC00032	P0C843	101 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	BGN	P21810	368 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	TIMP3	P35625	211 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	KRT20	P35900	424 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	EMD	P50402	254 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	TLE4	Q04727	773 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	DUSP8	Q13202	625 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	XKR7	Q5GH72	579 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	FAM9C	Q8IZT9	166 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	RPRML	Q8N4K4	120 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	11.19	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	HGD	Q93099	445 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	ARL8A	Q96BM9	186 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	SLC35A4	Q96G79	324 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	FCRL1	Q96LA6	429 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	C20orf27	Q9GZN8	174 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	NIN	Q8N4C6	2090 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	NCKAP5	O14513	1909 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464		A0A087WV62	115 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464		A0A0G2JNJ9	132 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	TTC36	A6NLP5	189 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	DVL2	O14641	736 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	SNPH	O15079	494 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	CBR3	O75828	277 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	HSPA4L	O95757	839 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	PCSK2	P16519	638 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	DDC	P20711	480 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	GRK2	P25098	689 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	PTPN6	P29350	595 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	DUSP2	Q05923	314 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	TTMP	Q5BVD1	217 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	VASN	Q6EMK4	673 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	NOXRED1	Q6NXP6	359 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	TMEM64	Q6YI46	380 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	HDX	Q7Z353	690 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	PRR22	Q8IZ63	422 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		11.18	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms