RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504292.1

ABCE1-204, Transcript of ATP binding cassette subfamily E member 1, human

TSL 3

Gene ABCE1, Length 625 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCE1-204	ENST00000504292	STK4	Q13043	487 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	SARM1	Q6SZW1	724 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	DEFB106A	Q8N104	65 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	ZNF611	Q8N823	705 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	FAM81B	Q96LP2	452 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	PSMB7	Q99436	277 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	HGH1	Q9BTY7	390 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	ING2	Q9H160	280 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	MUC13	Q9H3R2	512 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	PDE7B	Q9NP56	450 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292		A0A087WW49	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292		K7EM74	188 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	LRRTM2	O43300	516 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	GRAP2	O75791	330 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	KIAA0754	O94854	1291 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	YEATS4	O95619	227 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	IGHE	P01854	428 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	FGF1	P05230	155 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	FYN	P06241	537 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	CASP1	P29466	404 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	KRT9	P35527	623 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	SULT1E1	P49888	294 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	PRKAA1	Q13131	559 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	NR1D2	Q14995	579 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	MEA1	Q16626	185 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	UGP2	Q16851	508 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	ALF	Q53S48	1182 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	PXK	Q7Z7A4	578 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	SYVN1	Q86TM6	617 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	ZNF383	Q8NA42	475 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	LURAP1	Q96LR2	239 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	PPM1M	Q96MI6	270 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	DACH2	Q96NX9	599 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	OR6C1	Q96RD1	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	USP28	Q96RU2	1077 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	DDO	Q99489	341 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	PLK3	Q9H4B4	646 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	ACTL8	Q9H568	366 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	C5AR2	Q9P296	337 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	AP2A2	O94973	939 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	IGLV3-25	P01717	112 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	PTPN4	P29074	926 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	CDH11	P55287	796 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	NFATC2	Q13469	925 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	P2RY6	Q15077	328 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	PNCK	Q6P2M8	343 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	DOK6	Q6PKX4	331 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	TMEM110	Q86TL2	294 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ABCE1-204	ENST00000504292	RAB43	Q86YS6	212 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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