RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	9.82	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	MS4A8	Q9BY19	250 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	ACTR8	Q9H981	624 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	GP6	Q9HCN6	339 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PNV4	684 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	GLOD5	A6NK44	160 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	SHOX	O15266	292 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF205	O95201	554 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR75	O95800	540 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	CD247	P20963	164 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	CRYGS	P22914	178 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	PTPN6	P29350	595 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	SIRPA	P78324	504 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC7A5	Q01650	507 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	VEZF1	Q14119	521 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	KHDRBS2	Q5VWX1	349 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2A2	Q6IF42	318 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	MED27	Q6P2C8	311 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	AAGAB	Q6PD74	315 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF550	Q7Z398	422 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	IFNE	Q86WN2	208 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	GPSM1	Q86YR5	675 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	EXT2	Q93063	718 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	RGMA	Q96B86	450 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	OR51B5	Q9H339	312 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	SERHL	Q9NQF3	203 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	CD274	Q9NZQ7	290 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	FETUB	Q9UGM5	382 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	NIN	Q8N4C6	2090 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM82	A0PJX8	343 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	C16orf97	H3BN30	126 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	TAPBP	O15533	448 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	PRAMEF4	O60810	478 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	SCEL	O95171	688 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	NR2F6	P10588	404 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	CD22	P20273	847 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	SERPINB1	P30740	379 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	STAR	P49675	285 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	TAS2R39	P59534	338 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	TNK1	Q13470	666 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	NNAT	Q16517	81 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	SPC24	Q8NBT2	197 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM58	Q8NG06	486 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	WDR34	Q96EX3	536 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	PGM2	Q96G03	612 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	SFXN2	Q96NB2	322 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	NCKAP5	O14513	1909 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	PLOD2	O00469	737 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	CBR3	O75828	277 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	TNFSF13	O75888	250 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	CRH	P06850	196 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC35E2B	P0CK96	405 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC35E2	P0CK97	266 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	NT5E	P21589	574 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	PIK3R1	P27986	724 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	ABCD3	P28288	659 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	UGT2B10	P36537	528 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	9.79	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	PHEX	P78562	749 aa		9.79	□□□□□ -0.84

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms