RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 OXA1LQ15070 435 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 SYPL1Q16563 259 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 REEP3Q6NUK4 255 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 ZNF793Q6ZN11 406 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 DEF8Q6ZN54 512 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 CCDC103Q8IW40 242 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 RAB42Q8N4Z0 105 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 ABHD11Q8NFV4 315 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 OR4E2Q8NGC2 313 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 OR52E1Q8NGJ3 308 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 FKBP10Q96AY3 582 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 TBC1D20Q96BZ9 403 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 MTERF3Q96E29 417 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 COL21A1Q96P44 957 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 ALPK1Q96QP1 1244 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 ROGDIQ9GZN7 287 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 DUSP21Q9H596 190 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 SCPEP1Q9HB40 452 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 TMEM9Q9P0T7 183 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 ACSL5Q9ULC5 683 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 CFL2Q9Y281 166 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 C4orf51C9J302 202 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 PGRMC2O15173 223 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 SLC28A2O43868 658 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 SOX14O95416 240 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 EML2O95834 649 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 IFNW1P05000 195 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 MAGP20916 626 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 CD72P21854 359 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 EVI2BP34910 448 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 BCL6P41182 706 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 GPR3P46089 330 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 GCGRP47871 477 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 ST13P50502 369 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 RBBP4Q09028 425 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 CLVS2Q5SYC1 327 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 IKBIPQ70UQ0 350 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 CADM2Q8N3J6 435 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 AQP11Q8NBQ7 271 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 CCL4L1Q8NHW4 92 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 APH1BQ8WW43 257 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 WFDC6Q9BQY6 131 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 ZPBPQ9BS86 351 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 AICDAQ9GZX7 198 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 HOXD1Q9GZZ0 328 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 RHBGQ9H310 441 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 TMEM38AQ9H6F2 299 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 ZNF556Q9HAH1 456 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 PELI2Q9HAT8 420 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 C12orf10Q9HB07 376 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 ACER3Q9NUN7 267 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 IMPAD1Q9NX62 359 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 C12orf71A8MTZ7 269 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 RFPL3O75679 317 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 SERPINI2O75830 405 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 IFNA14P01570 189 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 CSF2P04141 144 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 ERGP11308 486 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 CFL1P23528 166 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 FEN1P39748 380 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 BLVRAP53004 296 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 NCS1P62166 190 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 RPS21P63220 83 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 MICAQ29983 383 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 FAM205BPQ63HN1 556 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 OR4C11Q6IEV9 310 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 ARMC8Q8IUR7 673 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 CCDC116Q8IYX3 515 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 NDNFQ8TB73 568 aa6.59□□□□□ -1.35
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HERC4-211ENST00000492996 CCDC120Q96HB5 630 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 HRASLS5Q96KN8 279 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 BBS4Q96RK4 519 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 PIP5K1AQ99755 562 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 TMEM246Q9BRR3 403 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 COPS4Q9BT78 406 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 APOOQ9BUR5 198 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 BTBD1Q9H0C5 482 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 SYNPO2LQ9H987 977 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 HMG20AQ9NP66 347 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 EQTNQ9NQ60 294 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 GPR83Q9NYM4 423 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 BOLA1Q9Y3E2 137 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC4-211ENST00000492996 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa6.58□□□□□ -1.36
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