RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492485.5

TRIOBP-211, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TRIOBP, Length 3,948 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-211ENST00000492485 NDUFAF7Q7L592 441 aa11.69□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 SERPINA11Q86U17 422 aa11.69□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 CPA6Q8N4T0 437 aa11.69□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 OR4M2Q8NGB6 313 aa11.69□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 RGMAQ96B86 450 aa11.69□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 C7orf34Q96L11 122 aa11.69□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM106CQ9BVX2 250 aa11.69□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 TTLL2Q9BWV7 592 aa11.69□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 MVB12BQ9H7P6 319 aa11.69□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM27Q9HBJ8 222 aa11.69□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 CENPMQ9NSP4 180 aa11.69□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 MGAT4CQ9UBM8 478 aa11.69□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 OSGIN1Q9UJX0 560 aa11.69□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 IGLON5A6NGN9 336 aa11.69□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 ACADMP11310 421 aa11.69□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 HSD3B1P14060 373 aa11.69□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 TGM1P22735 817 aa11.69□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 MPIP34949 423 aa11.69□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP11.69□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 EFR3AQ14156 821 aa11.69□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 DMRTC1Q5HYR2 192 aa11.69□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 UNC5DQ6UXZ4 953 aa11.69□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 FAM220AQ7Z4H9 259 aa11.69□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 HDDC3Q8N4P3 179 aa11.69□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 GALNT6Q8NCL4 622 aa11.69□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 OR6T1Q8NGN1 323 aa11.69□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 CD180Q99467 661 aa11.69□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 PFDN2Q9UHV9 154 aa11.69□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 CERS1P27544 350 aa11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 RPS27P42677 84 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 METAP1P53582 386 aa11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 SKP1P63208 163 aa11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 LIPJQ5W064 366 aa11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 OR13C5Q8NGS8 318 aa11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 DNAJB8Q8NHS0 232 aa11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 CLSTN3Q9BQT9 956 aa11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 NDC1Q9BTX1 674 aa11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 EVA1BQ9NVM1 165 aa11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 A0A1W2PQY0 241 aa11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 UNCXA6NJT0 531 aa11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 SYN1P17600 705 aa11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 IMPA1P29218 277 aa11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 WNT4P56705 351 aa11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 FXYD6P3P58550 94 aa11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 BNC1Q01954 994 aa11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 LTB4RQ15722 352 aa11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 LIN54Q6MZP7 749 aa11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 TTLL10Q6ZVT0 673 aa11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 OAFQ86UD1 273 aa11.68□□□□□ -0.54
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TRIOBP-211ENST00000492485 ARMC10Q8N2F6 343 aa11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 MFSD4AQ8N468 514 aa11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 PEX13Q92968 403 aa11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 LMF1Q96S06 567 aa11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 RDH14Q9HBH5 336 aa11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 C14orf105Q9NVL8 296 aa11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 TAS2R10Q9NYW0 307 aa11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 MAST2Q6P0Q8 1798 aa11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 LDB3O75112 727 aa11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 OR7A10O76100 309 aa11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 PLGP00747 810 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 DDCP20711 480 aa11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 MAGEA11P43364 429 aa11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 HTR3AP46098 478 aa11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 AKR1C2P52895 323 aa11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 AKR1C1Q04828 323 aa11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 ST3GAL3Q11203 375 aa11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 C1orf61Q13536 156 aa11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 SLC36A4Q6YBV0 504 aa11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 USP51Q70EK9 711 aa11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 NUP50Q9UKX7 468 aa11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 MED31Q9Y3C7 131 aa11.68□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 LCN1P31025 176 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 ETV5P41161 510 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 ETV1P50549 477 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 CHRNEQ04844 493 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 NKPD1Q17RQ9 610 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 LDLRAD1Q5T700 205 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 ENPP7Q6UWV6 458 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 COMMD7Q86VX2 200 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 PLCZ1Q86YW0 608 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 GALNT13Q8IUC8 556 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 JAGN1Q8N5M9 183 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 ACBD7Q8N6N7 88 aa11.67□□□□□ -0.54
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