RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF321PQ8N8H1 164 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 MORN4Q8NDC4 146 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 CAVIN3Q969G5 261 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 KIAA1191Q96A73 305 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 FAR2Q96K12 515 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 CAPZA3Q96KX2 299 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 SGCZQ96LD1 299 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 RASL10BQ96S79 203 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 SERINC2Q96SA4 455 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 CSF3RQ99062 836 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 TTYH2Q9BSA4 534 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 TMEM79Q9BSE2 394 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 TTTY12Q9BZ98 90 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 DERL2Q9GZP9 239 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 DEFB127Q9H1M4 99 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 CXXC4Q9H2H0 198 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 PROK2Q9HC23 129 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 LYRM4Q9HD34 91 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 KCNJ16Q9NPI9 418 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 SMYD2Q9NRG4 433 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 PNPLA3Q9NST1 481 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 FBXO34Q9NWN3 711 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 HPF1Q9NWY4 346 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 KCNN3Q9UGI6 736 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 ASIC3Q9UHC3 531 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC23A1Q9UHI7 598 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 CHMP2BQ9UQN3 213 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM215AQ9Y5M1 114 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 NAV3Q8IVL0 2385 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF407Q9C0G0 2248 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 ABCA4P78363 2273 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 DNAJC13O75165 2243 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 A0A088AWK7 358 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 NPIPA2E9PIF3 369 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 NPIPA3F8WFD2 350 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 WWP2O00308 870 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 KLK8O60259 260 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 WDR47O94967 919 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 SPDEFO95238 335 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 NADKO95544 446 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 ETHE1O95571 254 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 C1QAP02745 245 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 IGKV3-11P04433 115 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 AMY1AP04745 511 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 CD1EP15812 388 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 BMP5P22003 454 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC6A2P23975 617 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 ACVR2AP27037 513 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 SOX3P41225 446 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 PLA2G16P53816 162 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC16A1P53985 500 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 MTTPP55157 894 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 ARL4CP56559 192 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC13A2Q13183 592 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 DOC2AQ14183 400 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 TBCCQ15814 346 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 MPEG1Q2M385 716 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 SULT1C3Q6IMI6 304 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 ADNP2Q6IQ32 1131 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF793Q6ZN11 406 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 CLNKQ7Z7G1 428 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC22A16Q86VW1 577 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 LIX1LQ8IVB5 337 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 TMEM251Q8N6I4 163 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM47BQ8NA70 645 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 OR14A16Q8NHC5 309 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF721Q8TF20 911 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 NTNG2Q96CW9 530 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 CFAP36Q96G28 342 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 UBXN10Q96LJ8 280 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 F2RL3Q96RI0 385 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM173AQ9BQD7 235 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 CCDC77Q9BR77 488 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 TOR3AQ9H497 397 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 RHOJQ9H4E5 214 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 IL1RL2Q9HB29 575 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 DNAJC11Q9NVH1 559 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 DKK2Q9UBU2 259 aa5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.5 ms