RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 IDSP22304 550 aa12.71□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 GIFP27352 417 aa12.71□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 CD79BP40259 229 aa12.71□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 AKR1D1P51857 326 aa12.71□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 MC1RQ01726 317 aa12.71□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 CLVS2Q5SYC1 327 aa12.71□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa12.71□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 ART5Q96L15 291 aa12.71□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 SOSTQ9BQB4 213 aa12.71□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 ZBP1Q9H171 429 aa12.71□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 SGK2Q9HBY8 427 aa12.71□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 SLAMF7Q9NQ25 335 aa12.71□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 CTPS2Q9NRF8 586 aa12.71□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 ANGPT4Q9Y264 503 aa12.71□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 SLC16A8O95907 504 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 MPC1LP0DKB6 136 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 PRPH2P23942 346 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 GABRA5P31644 462 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 RPS26P62854 115 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 RAE1P78406 368 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 GRM7Q14831 915 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 LY6G5CQ5SRR4 150 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 SAMD12Q8N8I0 201 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 KREMEN2Q8NCW0 462 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 RNFT2Q96EX2 444 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 KLHL15Q96M94 604 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 DPAGT1Q9H3H5 408 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 SERHL2Q9H4I8 314 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 IFT46Q9NQC8 304 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 SDHAF2Q9NX18 166 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 SH2B3Q9UQQ2 575 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 CACNG2Q9Y698 323 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 NOTCH4Q99466 2003 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 HIDE1A8MVS5 230 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 NME6O75414 186 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 ASMTP46597 345 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 LIMS1P48059 325 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 TPMTP51580 245 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 CTAG1AP78358 180 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 NTHL1P78549 312 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 GRIN2CQ14957 1233 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 ZNF385BQ569K4 471 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 AGTRAPQ6RW13 159 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 GHITMQ9H3K2 345 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 TBX21Q9UL17 535 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 FKBP7Q9Y680 259 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 WNT6Q9Y6F9 365 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 CHD9Q3L8U1 2897 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 SHISA3A0PJX4 238 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 FKTNO75072 461 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 RGS11O94810 467 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 CXCL14O95715 111 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 SOD1P00441 154 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 PLATP00750 562 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 HK1P19367 917 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 DRD5P21918 477 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 MVDP53602 400 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 PLA1AQ53H76 456 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 CDKL4Q5MAI5 379 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 LILRA6Q6PI73 481 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 TMEM91Q6ZNR0 172 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 OR52N2Q8NGI0 321 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 PTGFRNQ9P2B2 879 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 KLHL42Q9P2K6 505 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 MGAT4BQ9UQ53 548 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 HRH3Q9Y5N1 445 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 HELZP42694 1942 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 H1F0P07305 194 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 TIMP2P16035 220 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 TSPAN5P62079 268 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 ACSM5Q6NUN0 579 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 ASZ1Q8WWH4 475 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 MS4A3Q96HJ5 214 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 ZFP3Q96NJ6 502 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 CACNG6Q9BXT2 260 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 C1GALT1Q9NS00 363 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 ATG13O75143 517 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 TCRBP04435 133 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-212ENST00000488380 HLA-DPB1P04440 258 aa12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.8 ms