RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 ESRRBO95718 433 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 EPPINO95925 133 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 OTCP00480 354 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 CPMP14384 443 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 CD1EP15812 388 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 GPX3P22352 226 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 ABCD3P28288 659 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 SOX18P35713 384 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 FEN1P39748 380 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 KIR2DL3P43628 341 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 MASP1P48740 699 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 CDK9P50750 372 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 ZNF136P52737 540 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 PKNOX1P55347 436 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 CBX1P83916 185 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 MGAT2Q10469 447 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 TOMM20Q15388 145 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 LETMD1Q6P1Q0 360 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 PLXDC2Q6UX71 529 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 ADCY4Q8NFM4 1077 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 OR4F6Q8NGB9 312 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 TP53INP1Q96A56 240 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 HBEGFQ99075 208 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 NTMT1Q9BV86 223 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 BRINP2Q9C0B6 783 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 EHD3Q9NZN3 535 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 B4GALT7Q9UBV7 327 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 CES1P1Q9UKY3 287 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 SLC12A4Q9UP95 1085 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 C15orf41Q9Y2V0 281 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 DOCK7Q96N67 2140 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 HSPB2A8KAH6 182 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 AHRRA9YTQ3 701 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 NME6O75414 186 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 PDYNP01213 254 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 HPNP05981 417 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 PORP16435 677 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 BMP7P18075 431 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 MAPK12P53778 367 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 FOXA1P55317 472 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 IFT88Q13099 833 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 LTB4RQ15722 352 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 HSPB2Q16082 182 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 SH2D4BQ5SQS7 431 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 KANK2Q63ZY3 851 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 CLEC6AQ6EIG7 209 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 VASNQ6EMK4 673 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 COMMD6Q7Z4G1 85 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 MILR1Q7Z6M3 343 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 PACS2Q86VP3 889 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 METTL4Q8N3J2 472 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 AGR3Q8TD06 166 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 NTNG2Q96CW9 530 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 KCNA7Q96RP8 456 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 TRIB1Q96RU8 372 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 NODALQ96S42 347 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 ITPAQ9BY32 194 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 UGT2B28Q9BY64 529 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 RABEP2Q9H5N1 569 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 ANKRA2Q9H9E1 313 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 GALNT9Q9HCQ5 603 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 TRPS1Q9UHF7 1281 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 BCAP29Q9UHQ4 241 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 STK38LQ9Y2H1 464 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 TRAF6Q9Y4K3 522 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
PRAME-212ENST00000485532 CAPN14A8MX76 684 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 SYT5O00445 386 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 AZIN1O14977 448 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 SNX4O95219 450 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 ENO1P06733 434 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 FGF4P08620 206 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 PTPN6P29350 595 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 PTGDSP41222 190 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 ASCL1P50553 236 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 RPL14P50914 215 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 NRG3P56975 720 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 CEBPEQ15744 281 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 UGT3A2Q3SY77 523 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 GGTA1PQ4G0N0 100 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 TBCELQ5QJ74 424 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 SLC48A1Q6P1K1 146 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa11.52□□□□□ -0.57
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