RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483859.6

SENP6-208, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 1,013 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-208ENST00000483859 PHOX2AO14813 284 aa2.46□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 RTL8CO15255 209 aa2.46□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 APBB3O95704 486 aa2.46□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 HOXB7P09629 217 aa2.46□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 PTPN6P29350 595 aa2.46□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 PPP2R1BP30154 601 aa2.46□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 BRCC3P46736 316 aa2.46□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 HTR5AP47898 357 aa2.46□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 SLC7A2P52569 658 aa2.46□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 ERVPABLB-1P60509 514 aa2.46□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 ZP4Q12836 540 aa2.46□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 NME3Q13232 169 aa2.46□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 SNX1Q13596 522 aa2.46□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 SLC10A1Q14973 349 aa2.46□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 TGIF1Q15583 401 aa2.46□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 ZIC1Q15915 447 aa2.46□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 C15orf32Q32M92 178 aa2.46□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 ADPRMQ3LIE5 342 aa2.46□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 SEL1L3Q68CR1 1132 aa2.46□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 PRR5LQ6MZQ0 368 aa2.46□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 IRGCQ6NXR0 463 aa2.46□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 WASH2PQ6VEQ5 465 aa2.46□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa2.46□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 UNC5CLQ8IV45 518 aa2.46□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa2.46□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 OR52B4Q8NGK2 314 aa2.46□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 RFESDQ8TAC1 157 aa2.46□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 FNDC8Q8TC99 324 aa2.46□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 TBCKQ8TEA7 893 aa2.46□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 FCGR1BQ92637 280 aa2.46□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 TESK2Q96S53 571 aa2.46□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 CCT8L2Q96SF2 557 aa2.46□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 AMBNQ9NP70 447 aa2.46□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 GDAP2Q9NXN4 497 aa2.46□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa2.46□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 FKBP7Q9Y680 259 aa2.46□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 PARD3Q8TEW0 1356 aa2.46□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 PDXKO00764 312 aa2.45□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 CFLARO15519 480 aa2.45□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 BUB1O43683 1085 aa2.45□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 TYROBPO43914 113 aa2.45□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 RHBDL1O75783 438 aa2.45□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 AKR7A3O95154 331 aa2.45□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 CA3P07451 260 aa2.45□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 SLC35E2P0CK97 266 aa2.45□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 LAMP1P11279 417 aa2.45□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 FASP25445 335 aa2.45□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 OR1D4P47884 311 aa2.45□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 CXCL6P80162 114 aa2.45□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 PAX2Q02962 417 aa2.45□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 SRYQ05066 204 aa2.45□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 PPP1R3AQ16821 1122 aa2.45□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa2.45□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 HIGD2BQ4VC39 106 aa2.45□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa2.45□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 RAET1GQ6H3X3 334 aa2.45□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 CGB2Q6NT52 195 aa2.45□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 UNC5DQ6UXZ4 953 aa2.45□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 ZNF600Q6ZNG1 722 aa2.45□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 STOX1Q6ZVD7 989 aa2.45□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 PAQR9Q6ZVX9 377 aa2.45□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 ZSCAN30Q86W11 494 aa2.45□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 CENPSQ8N2Z9 138 aa2.45□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 LINC00612Q8N6U2 182 aa2.45□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 AGAP11Q8TF27 550 aa2.45□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa2.45□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 SELENOMQ8WWX9 145 aa2.45□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 APOL2Q9BQE5 337 aa2.45□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 TM2D1Q9BX74 207 aa2.45□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 RAB17Q9H0T7 212 aa2.45□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 IKZF5Q9H5V7 419 aa2.45□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 ACTR3BQ9P1U1 418 aa2.45□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 Q9UF83 564 aa2.45□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 POGZQ7Z3K3 1410 aa2.44□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 RGSL1A5PLK6 1076 aa2.44□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 LGALS8O00214 317 aa2.44□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 ALOX15BO15296 676 aa2.44□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 LATO43561 262 aa2.44□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 EFNA2O43921 213 aa2.44□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 NDUFA7O95182 113 aa2.44□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 THY1P04216 161 aa2.44□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 UMPSP11172 480 aa2.44□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 RALAP11233 206 aa2.44□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 PVRP15151 417 aa2.44□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 DNAJB1P25685 340 aa2.44□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP2.44□□□□□ -2.022e-6■■□□□ 12.6
SENP6-208ENST00000483859 GPC3P51654 580 aa2.44□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 TFDP1Q14186 410 aa2.44□□□□□ -2.02
SENP6-208ENST00000483859 Q1RN00 199 aa2.44□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 500.5 ms