RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 OR4N2Q8NGD1 307 aa19.21■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 RILPQ96NA2 401 aa19.21■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa19.21■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 NTMQ9P121 344 aa19.21■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
ACTB-211ENST00000480301 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 PTPN13Q12923 2485 aa19.2■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 NINQ8N4C6 2090 aa19.2■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 OR6C70A6NIJ9 312 aa19.2■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 SDHDO14521 159 aa19.2■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 TSPAN2O60636 221 aa19.2■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 REM1O75628 298 aa19.2■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 SASH3O75995 380 aa19.2■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 IGHG3P01860 377 aa19.2■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 CELA3AP09093 270 aa19.2■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 LBPP18428 481 aa19.2■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 GPC1P35052 558 aa19.2■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 PTGDSP41222 190 aa19.2■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 PSPHP78330 225 aa19.2■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 FNDC7Q5VTL7 733 aa19.2■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 TMEM198Q66K66 360 aa19.2■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 SLC35A4Q96G79 324 aa19.2■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa19.2■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 LIPGQ9Y5X9 500 aa19.2■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa19.19■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PRB8 838 aa19.19■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 HDAC3O15379 428 aa19.19■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 SNX4O95219 450 aa19.19■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 KITP10721 976 aa19.19■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 ABOP16442 354 aa19.19■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 GAB1Q13480 694 aa19.19■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 NATD1Q8N6N6 113 aa19.19■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 NUP43Q8NFH3 380 aa19.19■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 GIMAP5Q96F15 307 aa19.19■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 COL21A1Q96P44 957 aa19.19■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 ADOQ96SZ5 270 aa19.19■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 ATAD3AQ9NVI7 634 aa19.19■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 TINAGQ9UJW2 476 aa19.19■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 ZNF407Q9C0G0 2248 aa19.19■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 GTF3C1Q12789 2109 aa19.18■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 EMC8O43402 210 aa19.18■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 ABCB7O75027 752 aa19.18■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 PTGS2P35354 604 aa19.18■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 MAP3K8P41279 467 aa19.18■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 PNLIPRP2P54317 469 aa19.18■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 SLC10A1Q14973 349 aa19.18■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 CYP27C1Q4G0S4 372 aa19.18■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 OGFOD2Q6N063 350 aa19.18■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa19.18■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 PAOXQ6QHF9 649 aa19.18■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 TRILQ7L0X0 811 aa19.18■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 CAMKMTQ7Z624 323 aa19.18■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 PACS2Q86VP3 889 aa19.18■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 DOLPP1Q86YN1 238 aa19.18■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa19.18■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 CEP70Q8NHQ1 597 aa19.18■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 OR5P2Q8WZ92 322 aa19.18■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 TMCO6Q96DC7 493 aa19.18■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 TMEM41AQ96HV5 264 aa19.18■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 ZNF597Q96LX8 424 aa19.18■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 DUSP26Q9BV47 211 aa19.18■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 METTL7AQ9H8H3 244 aa19.18■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 OR10H1Q9Y4A9 318 aa19.18■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 EXPH5Q8NEV8 1989 aa19.18■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 MYO7BQ6PIF6 2116 aa19.18■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa19.17■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 A0A1B0GVC2 190 aa19.17■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 TRPC5OSA6NMA1 111 aa19.17■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 SLCO1B7G3V0H7 640 aa19.17■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 CCL21O00585 134 aa19.17■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD28O15084 1053 aa19.17■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 ICOSLGO75144 302 aa19.17■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 EPHA3P29320 983 aa19.17■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 PRKAG1P54619 331 aa19.17■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 CASP6P55212 293 aa19.17■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 SNTA1Q13424 505 aa19.17■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 SLC30A6Q6NXT4 461 aa19.17■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 PSMA8Q8TAA3 256 aa19.17■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 FAM57AQ8TBR7 257 aa19.17■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 C3orf14Q9HBI5 128 aa19.17■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 GALNT9Q9HCQ5 603 aa19.17■□□□□ 0.66
ACTB-211ENST00000480301 Q9N2J8 555 aa19.17■□□□□ 0.66
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