RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475558.5

SHQ1-207, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-207ENST00000475558 IFNA8P32881 189 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 PCGF2P35227 344 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 SOAT1P35610 550 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 XCR1P46094 333 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 GZMMP51124 257 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 CLCN2P51788 898 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 CRISP3P54108 245 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 MTPNP58546 118 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 CDK6Q00534 326 aa6.55□□□□□ -1.36
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SHQ1-207ENST00000475558 MYBPC3Q14896 1274 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 C16orf72Q14CZ0 275 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
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SHQ1-207ENST00000475558 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa6.55□□□□□ -1.36
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SHQ1-207ENST00000475558 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa6.55□□□□□ -1.36
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SHQ1-207ENST00000475558 ARMC8Q8IUR7 673 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
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SHQ1-207ENST00000475558 MSRB3Q8IXL7 192 aa6.55□□□□□ -1.36
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SHQ1-207ENST00000475558 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 XAGE5Q8WWM1 108 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 NR4A3Q92570 626 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 FAM162AQ96A26 154 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 PEX11GQ96HA9 241 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 PYURFQ96I23 114 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 SLC45A3Q96JT2 553 aa6.55□□□□□ -1.36
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SHQ1-207ENST00000475558 IP6K3Q96PC2 410 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 BDH2Q9BUT1 245 aa6.55□□□□□ -1.36
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SHQ1-207ENST00000475558 GPR87Q9BY21 358 aa6.55□□□□□ -1.36
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SHQ1-207ENST00000475558 CXorf36Q9H7Y0 433 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.55□□□□□ -1.36
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SHQ1-207ENST00000475558 ADAP2Q9NPF8 381 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 DUSP22Q9NRW4 184 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
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SHQ1-207ENST00000475558 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
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SHQ1-207ENST00000475558 IFT52Q9Y366 437 aa6.55□□□□□ -1.36
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SHQ1-207ENST00000475558 PEX1O43933 1283 aa6.54□□□□□ -1.36
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SHQ1-207ENST00000475558 PDE5AO76074 875 aa6.54□□□□□ -1.36
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SHQ1-207ENST00000475558 HEXBP07686 556 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 TFPTP0C1Z6 253 aa6.54□□□□□ -1.36
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SHQ1-207ENST00000475558 NR2F1P10589 423 aa6.54□□□□□ -1.36
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SHQ1-207ENST00000475558 LIFP15018 202 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 CD1EP15812 388 aa6.54□□□□□ -1.36
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SHQ1-207ENST00000475558 SELENOWP63302 87 aa6.54□□□□□ -1.36
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SHQ1-207ENST00000475558 NSDHLQ15738 373 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 CYP27C1Q4G0S4 372 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF628Q5EBL2 1059 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 DESI1Q6ICB0 168 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 CBLL1Q75N03 491 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 ATCAYQ86WG3 371 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 RNF130Q86XS8 419 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 SPPL2CQ8IUH8 684 aa6.54□□□□□ -1.36
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