RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462256.5

DDX39B-215, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 4,027 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-215ENST00000462256 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 OR7G1Q8NGA0 311 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 NT5CQ8TCD5 201 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 SLC39A7Q92504 469 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 LRFN5Q96NI6 719 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 OR4K3Q96R72 315 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 NRTNQ99748 197 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 MIA3Q5JRA6 1907 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 PLPP1O14494 284 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 KRT36O76013 467 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 SLITRK5O94991 958 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 TSPAN12O95859 305 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 PTGER1P34995 402 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 DIO3P55073 304 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 SLC26A5P58743 744 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 FOXK1P85037 733 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 MERTKQ12866 999 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 KLRB1Q12918 225 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 KCNAB2Q13303 367 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 RTP5Q14D33 572 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 LANCL3Q6ZV70 420 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 SLC2A12Q8TD20 617 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 DEFB127Q9H1M4 99 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 TPT1P8Q9HAU6 139 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 TAGLN3Q9UI15 199 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 EDARQ9UNE0 448 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 VSTM2BA6NLU5 285 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 BBIP1A8MTZ0 92 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 KLF11O14901 512 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 SUV39H1O43463 412 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 ITGA10O75578 1167 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 CD247P20963 164 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 AHCYP23526 432 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 CLDN8P56748 225 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 WDR4P57081 412 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 PPIAP62937 165 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 NR1D2Q14995 579 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 ZIC1Q15915 447 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 TCTN3Q6NUS6 607 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF100Q8IYN0 542 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 EXD3Q8N9H8 876 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 OR2T12Q8NG77 320 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 EPYCQ99645 322 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 LRMDAQ9H2I8 198 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 TPK1Q9H3S4 243 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 PILRAQ9UKJ1 303 aa8.65□□□□□ -1.02
DDX39B-215ENST00000462256 CCDC160A6NGH7 325 aa8.65□□□□□ -1.03
DDX39B-215ENST00000462256 C9orf172C9J069 976 aa8.65□□□□□ -1.03
DDX39B-215ENST00000462256 P2RX6O15547 441 aa8.65□□□□□ -1.03
DDX39B-215ENST00000462256 CBFA2T3O75081 653 aa8.65□□□□□ -1.03
DDX39B-215ENST00000462256 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
DDX39B-215ENST00000462256 SSTR4P31391 388 aa8.65□□□□□ -1.03
DDX39B-215ENST00000462256 RELAQ04206 551 aa8.65□□□□□ -1.03
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF311Q5JNZ3 666 aa8.65□□□□□ -1.03
DDX39B-215ENST00000462256 ANKK1Q8NFD2 765 aa8.65□□□□□ -1.03
DDX39B-215ENST00000462256 ACTRT3Q9BYD9 372 aa8.65□□□□□ -1.03
DDX39B-215ENST00000462256 SLC25A18Q9H1K4 315 aa8.65□□□□□ -1.03
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
DDX39B-215ENST00000462256 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa8.65□□□□□ -1.03
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF726A6NNF4 738 aa8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-215ENST00000462256 G3V2L1 256 aa8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-215ENST00000462256 H3BML4 177 aa8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-215ENST00000462256 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-215ENST00000462256 BCHEP06276 602 aa8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-215ENST00000462256 MSL3P1P0C860 447 aa8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-215ENST00000462256 CYP4B1P13584 511 aa8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-215ENST00000462256 POU1F1P28069 291 aa8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-215ENST00000462256 UFM1P61960 85 aa8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-215ENST00000462256 RUNX2Q13950 521 aa8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-215ENST00000462256 BCL2A1Q16548 175 aa8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-215ENST00000462256 IGSF11Q5DX21 431 aa8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-215ENST00000462256 OR5M10Q6IEU7 315 aa8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF550Q7Z398 422 aa8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-215ENST00000462256 VN1R4Q7Z5H5 301 aa8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-215ENST00000462256 LAS2Q8IYD9 372 aa8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-215ENST00000462256 RNF148Q8N7C7 305 aa8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-215ENST00000462256 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-215ENST00000462256 UCN3Q969E3 161 aa8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-215ENST00000462256 SLC6A16Q9GZN6 736 aa8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-215ENST00000462256 MYLK2Q9H1R3 596 aa8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-215ENST00000462256 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-215ENST00000462256 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-215ENST00000462256 FBP2O00757 339 aa8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-215ENST00000462256 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-215ENST00000462256 OR2J2O76002 312 aa8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-215ENST00000462256 FGF4P08620 206 aa8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-215ENST00000462256 OR12D1P0DN82 309 aa8.64□□□□□ -1.03
DDX39B-215ENST00000462256 LAMP1P11279 417 aa8.64□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms