RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 GNRHR2Q96P88 292 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 KLHDC3Q9BQ90 382 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM173AQ9BQD7 235 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 ANGPTL4Q9BY76 406 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 REEP4Q9H6H4 257 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 AKTIPQ9H8T0 292 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 IL1RL2Q9HB29 575 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 GALNT9Q9HCQ5 603 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 FBXO34Q9NWN3 711 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 SH3BP4Q9P0V3 963 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 SPRR3Q9UBC9 169 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP6V1HQ9UI12 483 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 ENTPD4Q9Y227 616 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 DCHS2Q6V1P9 2916 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A087WV62 115 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1B0GVC2 190 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 FRG2CA6NGY1 282 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 NPIPA2E9PIF3 369 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 NPIPA3F8WFD2 350 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 SDHDO14521 159 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF195O14628 629 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 ICOSLGO75144 302 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 SNNO75324 88 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 ERN1O75460 977 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 SASH3O75995 380 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 IGHG3P01860 377 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 G6PDP11413 515 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 NEFHP12036 1026 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 CYP4B1P13584 511 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 DRD5P21918 477 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 IL12AP29459 219 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 MPIP34949 423 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 GSTM5P46439 218 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 TRPC1P48995 793 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 DIO3P55073 304 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 WNT3P56703 355 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 HSPB3Q12988 150 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 RPS6KA2Q15349 733 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF787Q6DD87 383 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 RTL6Q6ICC9 239 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 APOOLQ6UXV4 268 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 TRILQ7L0X0 811 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 MAVSQ7Z434 540 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 ZAR1Q86SH2 424 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 GALNT10Q86SR1 603 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 CD163Q86VB7 1156 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 RIMKLAQ8IXN7 391 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 TAGAPQ8N103 731 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC34A3Q8N130 599 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 OR2L13Q8N349 312 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 WDSUB1Q8N9V3 476 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 C17orf47Q8NEP4 570 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 OR5M9Q8NGP3 310 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 PIK3R3Q92569 461 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 DIO2Q92813 273 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 TUBGCP3Q96CW5 907 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 HSPBAP1Q96EW2 488 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 TEX37Q96LM6 180 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 RILPQ96NA2 401 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 BTBD9Q96Q07 612 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 DMRTA2Q96SC8 542 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 ADOQ96SZ5 270 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 CCT7Q99832 543 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 YIPF4Q9BSR8 244 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC6A15Q9H2J7 730 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 UBQLN3Q9H347 655 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 ZFP64Q9NPA5 681 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 PNPLA3Q9NST1 481 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 NTMQ9P121 344 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 PRODH2Q9UF12 536 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 MEMO1Q9Y316 297 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 RAP2CQ9Y3L5 183 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 KCNE3Q9Y6H6 103 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1B0GUH1 482 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 ANKRD33BA6NCL7 494 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM114B3SHH9 223 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 C9JVG2 144 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 C19orf84I3L1E1 186 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 ANKRD28O15084 1053 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 PDPK1O15530 556 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 SCN2BO60939 215 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 ERLIN1O75477 346 aa6.4□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms