RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447232.6

PMS1-215, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 2,576 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-215ENST00000447232 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa2.85□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 TIGD1Q96MW7 591 aa2.85□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 DUX5Q96PT3 197 aa2.85□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 LRRC37BQ96QE4 947 aa2.85□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 PANX2Q96RD6 677 aa2.85□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 PKP4Q99569 1192 aa2.85□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 KCNJ15Q99712 375 aa2.85□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 FSD1LQ9BXM9 530 aa2.85□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 HDHD5Q9BXW7 423 aa2.85□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 POTEKPQ9BYX7 375 aa2.85□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 G6PC2Q9NQR9 355 aa2.85□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa2.85□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 MOCS1Q9NZB8 636 aa2.85□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 RSPH14Q9UHP6 348 aa2.85□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 ZFP69BQ9UJL9 534 aa2.85□□□□□ -1.95
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PMS1-215ENST00000447232 C5orf63A6NC05 138 aa2.85□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 NPIPA7E9PJI5 369 aa2.85□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 F8W8V4 182 aa2.85□□□□□ -1.95
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PMS1-215ENST00000447232 SLC16A8O95907 504 aa2.85□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 NPIPA8P0DM63 369 aa2.85□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 GRK2P25098 689 aa2.85□□□□□ -1.95
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PMS1-215ENST00000447232 PHC1P78364 1004 aa2.85□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 CHRNB3Q05901 458 aa2.85□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 RPS6KA1Q15418 735 aa2.85□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 TRIP10Q15642 601 aa2.85□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 CARTPTQ16568 116 aa2.85□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 MST1LQ2TV78 715 aa2.85□□□□□ -1.95
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PMS1-215ENST00000447232 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa2.85□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa2.85□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa2.85□□□□□ -1.95
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PMS1-215ENST00000447232 Q6ZSR9 355 aa2.85□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 IFNEQ86WN2 208 aa2.85□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 CREBRFQ8IUR6 639 aa2.85□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 ZNF619Q8N2I2 560 aa2.85□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 KIR3DL3Q8N743 410 aa2.85□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa2.85□□□□□ -1.95
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PMS1-215ENST00000447232 NT5CQ8TCD5 201 aa2.85□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 RNF157Q96PX1 679 aa2.85□□□□□ -1.95
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PMS1-215ENST00000447232 SEC61A2Q9H9S3 476 aa2.85□□□□□ -1.95
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PMS1-215ENST00000447232 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa2.84□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 CYR61O00622 381 aa2.84□□□□□ -1.95
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PMS1-215ENST00000447232 NDUFS4O43181 175 aa2.84□□□□□ -1.95
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PMS1-215ENST00000447232 OPN1MW3P0DN78 364 aa2.84□□□□□ -1.95
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PMS1-215ENST00000447232 GBX1Q14549 363 aa2.84□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 TMED2Q15363 201 aa2.84□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 TSC22D1Q15714 1073 aa2.84□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa2.84□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 SPDYAQ5MJ70 313 aa2.84□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 OLFML2AQ68BL7 652 aa2.84□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
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