RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443289.5

ATG4C-205, Transcript of autophagy related 4C cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4C, Length 603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4C-205ENST00000443289 MYNNQ9NPC7 610 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG4C-205ENST00000443289 PFDN4Q9NQP4 134 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG4C-205ENST00000443289 PRODH2Q9UF12 536 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG4C-205ENST00000443289 DNAJC13O75165 2243 aa14.96□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 LRRC3CA6NJW4 275 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 ACOX3O15254 700 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 BCKDHAP12694 445 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 ACVR2AP27037 513 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 ABCD3P28288 659 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 CHRNB4P30926 498 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 DUSP2Q05923 314 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 PMPCAQ10713 525 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 PRSS53Q2L4Q9 553 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 WLSQ5T9L3 541 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 IL23RQ5VWK5 629 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 FAM71E1Q6IPT2 247 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 MAVSQ7Z434 540 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 PACS2Q86VP3 889 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 CCDC116Q8IYX3 515 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 ADCY4Q8NFM4 1077 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 OR52R1Q8NGF1 315 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 LILRB4Q8NHJ6 448 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 ZNF675Q8TD23 568 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 ERP27Q96DN0 273 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 ZNF597Q96LX8 424 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 MAGEB18Q96M61 343 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 CCT7Q99832 543 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 ANGPTL4Q9BY76 406 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 MIEF1Q9NQG6 463 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 GIMAP4Q9NUV9 329 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 RNF6Q9Y252 685 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 CREBBPQ92793 2442 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 C19orf84I3L1E1 186 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 SDHDO14521 159 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 HDAC3O15379 428 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 WDR1O75083 606 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 PPM1BO75688 479 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 CBX7O95931 251 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 EPHA3P29320 983 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 SOX18P35713 384 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 CASP3P42574 277 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 KIR3DL1P43629 444 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 PPICP45877 212 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 NUP107P57740 925 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 PTGR1Q14914 329 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 NUP54Q7Z3B4 507 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 GDF7Q7Z4P5 450 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 HOMEZQ8IX15 550 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 PRR22Q8IZ63 422 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 KIRREL3Q8IZU9 778 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 NEIL3Q8TAT5 605 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 C7orf26Q96N11 449 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 RILPQ96NA2 401 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 SPOCK3Q9BQ16 436 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 ITPAQ9BY32 194 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 MEAF6Q9HAF1 191 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 EHD3Q9NZN3 535 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 DTX4Q9Y2E6 619 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 TMED5Q9Y3A6 229 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 GABRA1P14867 456 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 PCSK2P16519 638 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 DDCP20711 480 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 DRD5P21918 477 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 GDF1P27539 372 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 MAPK1P28482 360 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 MPIP34949 423 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 EMDP50402 254 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 DUSP8Q13202 625 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 LTB4RQ15722 352 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 ZNF628Q5EBL2 1059 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 NXNQ6DKJ4 435 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 TMEM81Q6P7N7 255 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 RPRMLQ8N4K4 120 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 NUDT8Q8WV74 236 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 TTYH2Q9BSA4 534 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 USH1CQ9Y6N9 552 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 NINQ8N4C6 2090 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 PKDREJQ9NTG1 2253 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 TRPC5OSA6NMA1 111 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4C-205ENST00000443289 TO15178 435 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms