RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435165.2

SGIP1-206, Transcript of SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SGIP1, Length 3,646 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1-206ENST00000435165 SIRT7Q9NRC8 400 aa3.56□□□□□ -1.84
SGIP1-206ENST00000435165 GFOD1Q9NXC2 390 aa3.56□□□□□ -1.84
SGIP1-206ENST00000435165 CRIM1Q9NZV1 1036 aa3.56□□□□□ -1.84
SGIP1-206ENST00000435165 NENFQ9UMX5 172 aa3.56□□□□□ -1.84
SGIP1-206ENST00000435165 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa3.56□□□□□ -1.84
SGIP1-206ENST00000435165 OR51B4Q9Y5P0 310 aa3.56□□□□□ -1.84
SGIP1-206ENST00000435165 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa3.55□□□□□ -1.84
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SGIP1-206ENST00000435165 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SGIP1-206ENST00000435165 KLF11O14901 512 aa3.55□□□□□ -1.84
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SGIP1-206ENST00000435165 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
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SGIP1-206ENST00000435165 FNDC11Q9BVV2 318 aa3.55□□□□□ -1.84
SGIP1-206ENST00000435165 SRRQ9GZT4 340 aa3.55□□□□□ -1.84
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SGIP1-206ENST00000435165 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SGIP1-206ENST00000435165 SLC28A3Q9HAS3 691 aa3.55□□□□□ -1.84
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SGIP1-206ENST00000435165 PIGTQ969N2 578 aa3.55□□□□□ -1.84
SGIP1-206ENST00000435165 LENG9Q96B70 501 aa3.55□□□□□ -1.84
SGIP1-206ENST00000435165 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SGIP1-206ENST00000435165 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SGIP1-206ENST00000435165 CHAMP1Q96JM3 812 aa3.55□□□□□ -1.84
SGIP1-206ENST00000435165 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
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