RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410856.1

RNU2-38P-201, Transcript of RNA, U2 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU2-38P, Length 79 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU2-38P-201ENST00000410856 S1PR3Q99500 378 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 SDF4Q9BRK5 362 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 FEM1AQ9BSK4 669 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 TM2D1Q9BX74 207 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 GPR173Q9NS66 373 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 ITIH6Q6UXX5 1313 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 GJE1A6NN92 205 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 NPIPA5E9PKD4 350 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 CCDC188H7C350 402 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 GFYI3L273 518 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 FYNP06241 537 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 FCER2P06734 321 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 SAA4P35542 130 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 GABPAQ06546 454 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 IL18R1Q13478 541 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 CAMK4Q16566 473 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 LRRC36Q1X8D7 754 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 LY6G6FQ5SQ64 297 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 CCDC70Q6NSX1 233 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 UNC5DQ6UXZ4 953 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 SPATA18Q8TC71 538 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 AGPAT1Q99943 283 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 LMAN1LQ9HAT1 526 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 IFT52Q9Y366 437 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 SHROOM3Q8TF72 1996 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 PLA2R1Q13018 1463 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 OAS1P00973 400 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 CISD3P0C7P0 127 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 MYBL1P10243 752 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 LBPP18428 481 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 UQCRC2P22695 453 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 NTSP30990 170 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 NPBWR1P48145 328 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 DPYSQ14117 519 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 IGFBP7Q16270 282 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 CDO1Q16878 200 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 CCDC57Q2TAC2 916 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 ERMARDQ5T6L9 678 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 STEAP1BQ6NZ63 245 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 HEXDCQ8WVB3 486 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 RIT1Q92963 219 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 MCHR2Q969V1 340 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 CEP170P1Q96L14 293 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 TXN2Q99757 166 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 SLC25A23Q9BV35 468 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 ABCG8Q9H221 673 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 TSPY26PQ9H489 355 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 SH2D2AQ9NP31 389 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 SIRT7Q9NRC8 400 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU2-38P-201ENST00000410856 CHUKO15111 745 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 B4GALT5O43286 388 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 CAPN3P20807 821 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 CPT2P23786 658 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 COL8A2P25067 703 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 DLSTP36957 453 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 BTDP43251 543 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 APOC4P55056 127 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 UBXN1Q04323 297 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 SPIN3Q5JUX0 258 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 MAATS1Q7Z4T9 603 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 CSNK1A1LQ8N752 337 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 OR52P1PQ8NH57 321 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 CKAP2Q8WWK9 683 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 HAVCR1Q96D42 359 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 ATG101Q9BSB4 218 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 MIS18AQ9NYP9 233 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 LIPGQ9Y5X9 500 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 SCN2AQ99250 2005 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 SDK2Q58EX2 2172 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 CTDNEP1O95476 244 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 ANP32DO95626 131 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 IGHV3-48P01763 117 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 PCCBP05166 539 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 SDC1P18827 310 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 NPY1RP25929 384 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 OTX2P32243 289 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 KIR3DL2P43630 455 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 IER3P46695 156 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 MTTPP55157 894 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU2-38P-201ENST00000410856 HAND2P61296 217 aa0.45□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.6 ms