RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM81AQ8TBF8 368 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 MIPOL1Q8TD10 442 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 GIMAP5Q96F15 307 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 HRASLS5Q96KN8 279 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 TGM7Q96PF1 710 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 RHNO1Q9BSD3 238 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 DGCR6LQ9BY27 220 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC38A1Q9H2H9 487 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 CHRDQ9H2X0 955 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 CAPN10Q9HC96 672 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 LYRM4Q9HD34 91 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 BCL2L10Q9HD36 194 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 UCKL1Q9NWZ5 548 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 SOHLH2Q9NX45 425 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 SCN3BQ9NY72 215 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 ERVK-18Q9QC07 812 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC13A4Q9UKG4 626 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 TPRKBQ9Y3C4 175 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A1W2PPC1 479 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 CYR61O00622 381 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 CHST10O43529 356 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 TRMUO75648 421 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 UGT2B17O75795 530 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 GPR75O95800 540 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 EPPINO95925 133 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 LGI1O95970 557 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 ALPPP05187 535 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 MAGEA8P43361 318 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 LIMS1P48059 325 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 CXCL12P48061 93 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 MAN2A2P49641 1150 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 PDX1P52945 283 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 GFERP55789 205 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 HPCAP84074 193 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 ERV3-1Q14264 604 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 SEC23BQ15437 767 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM214AQ32MH5 1076 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 CCNJQ5T5M9 372 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 XAF1Q6GPH4 301 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC81Q6ZN84 652 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 IQCHQ86VS3 1027 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 ENTHD1Q8IYW4 607 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 GALNT15Q8N3T1 639 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 CAMKK1Q8N5S9 505 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC7A13Q8TCU3 470 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 FBLIM1Q8WUP2 373 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 CDS1Q92903 461 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 ISOC1Q96CN7 298 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 SPACA7Q96KW9 195 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 PITX2Q99697 317 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 FNDC11Q9BVV2 318 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 GABARAPL3Q9BY60 117 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 GIN1Q9NXP7 522 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 PTTG2Q9NZH5 202 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 HCN3Q9P1Z3 774 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 KCND3Q9UK17 655 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 LIPT1Q9Y234 373 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 RNF6Q9Y252 685 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 MYO15AQ9UKN7 3530 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 OR2W5A6NFC9 320 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 RHPN2P1A8MT19 583 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 A8MVJ9 347 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 LMO7DNF2Z398 122 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 H3BN98 237 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 M0R129 80 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 ASNA1O43681 348 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 WBP4O75554 376 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 SOX14O95416 240 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 CBLP22681 906 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 TTKP33981 857 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 KRT20P35900 424 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 GGT2P36268 569 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 CTSKP43235 329 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 CAPZBP47756 277 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 AVPR1BP47901 424 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 NUDT6P53370 316 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 C21orf59P57076 290 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 NUP107P57740 925 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 NXPH1P58417 271 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 GABARAPL2P60520 117 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 HOXC5Q00444 222 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 DMWDQ09019 674 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 BNIP3Q12983 259 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 LSAMPQ13449 338 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 GPR68Q15743 365 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 DUSP5Q16690 384 aa3.72□□□□□ -1.81
LRRTM4-201ENST00000409088 CDC73Q6P1J9 531 aa3.72□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms